Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12717
- Subject:
- XM_006525497.3
- Aligned Length:
- 3587
- Identities:
- 2500
- Gaps:
- 760
Alignment
Query 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
|||||.||||||||||||||||..|||...|||.|.|||.|.|.|||..|..|.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGGACCACGAAAGAAAAGTGCTAAAGTGTGTGTGATGGACAGTGAGGTCGCTGAGGAAATGACAGCCGATGA 74
Query 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
|...||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 75 AGAGAAGGACTACATGAACCAGCTGTCACATGAAGTGCTCTGTCATATCTTCAGGTACCTGCCACTACAGGACA 148
Query 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||.||.
Sbjct 149 TCATGTGCATGGAATGCCTCTCTCGGAAGCTAAAGGAGGCAGTCACTCTGTATCTGAGAGTTGTCAGAGTGGTG 222
Query 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 223 GATCTCTGTGCAGGGCGCTGGTGGGAATATATGCCAAGTGGCTTCACAGATTCCAGTTTCCTAACCCTTTTGAA 296
Query 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTGTATGGCCTTCACCCTAGATACCTCGAGAGGCGAAGAGTGAGGGGCCAGG 370
Query 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGGCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
|||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 AGGCTTTCAGCATCCCAGGAGTCTTGGAAGCTTTGCAAGCGTGCCCAAACTTGGTGGGTGTAGAAACATCTCAT 444
Query 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCGCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAACGG 518
Query 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGCATTTCCGATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATCCCCATAGGAGCCAAAATCCAAACTTTGCATTTAGTTG 592
Query 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 GTGTCAATGTTCCTGAAATCCCTTGTATCCCTATGCTAAGGCACCTGTACATGAAGTGGGTGAGACTCACTAAA 666
Query 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
||||||||.||||||||.||||||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 CCACAGCCGTTTAAAGATTTCCTTTGCATCAGCTTGCGAACTTTTGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCAACAAA 740
Query 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
.|||||||||||.||.||.||.||||||||..|.||.||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 CTCCTTGAAATACGTGCCCTTGGTAACAGGTCTGGCATCTGCCCGTAACCTGGAACACTTGGAAATGGTTCGAG 814
Query 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
|.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 815 TCCCTTTCCTGGGAGGTCTCATCCAACACGTGGTTGAAGACAGCTGGAGATCAGGTGGTTTTAGGAACTTGCAC 888
Query 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
||||||||..|.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 889 ACTATTGTCTTAGGAGCTTGCAAGAATGCCCTGGAAGTAGACCTTGGCTACCTCATCATCACTGCTGCGCGAAG 962
Query 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
|||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GTTACATGAAGTTCGCATCCAGCCTTCTTTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAATTGG 1036
Query 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTGGGATATGTAGATGAGTTCTTGCTACAGAGCAGAATGGCGAATGCA 1110
Query 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GATTTGGTGAAGTATGGCTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATTACTGATATAGGGATGAAGGCAGT 1184
Query 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTATAACTGTCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
Query 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
|||||||||||||.||.||||..|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259 TCTCAGACCACTCGAGGTGGATGCGACTGGTTGATATCAACCTCGTGCGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGATTCT 1332
Query 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333 TTTGGCCAGTTTGTTGAATTATTGCCCAGCCTGGAATTTATTTCTCTGGACCAGATGTTCCGTGAGCCACCCAA 1406
Query 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
|||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407 GGGCTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGAACTGGAATTGGGGTTTCCTCAGCGCTTGTCAGCAACCAGAATT 1480
Query 1481 CCAACAATGAC---GATAATAATGC-CCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGA 1550
||||||||||| ||.|||||||| ||| ||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1481 CCAACAATGACAATGACAATAATGCTCCA-AATAACAACGCCAACCTCCATGATAACAATCACCATCACCCAGA 1553
Query 1551 TGACTCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGA-GCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTA 1623
|||.||.||.||.||.|||||||||||.|.|||.||.||..||||||| ||| ||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1554 TGATTCGGATGACGACAATGACTTTCGTCCAGACCTACAAGCAGGAGAGGCA-CAATTTGCAGCCGATGCGTTG 1626
Query 1624 AATGAGATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAG 1697
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||..||..||||||||||.
Sbjct 1627 AATGAGATGGAAGACATGGTCCAGGAAGATGGAGAACTGGTAGCCGAGAGTGGAAATGGTATGCCAGCTCACAA 1700
Query 1698 CCAGGCAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAA 1771
.|.||.|.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1701 TCGGGAAGTTCTTCCTGTGGATGCTGATGAGGAACAAGCAGGACCTAGTGGTCTACAACGCGTGGTAAAACCTA 1774
Query 1772 CCTCAATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCT 1845
|..|||||.|||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1775 CACCAATTGCTGATCACGATTCAGAGAGCGATGATGAAGAAGATAGTTTAGAACTCCAAGAAGTCTGGGCTCCT 1848
Query 1846 AAGAACGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAA-------- 1911
|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||..||||||||.|||
Sbjct 1849 AAGAATGGCACCCGGCGTTACTCAGAGCGGGAAGAAAAGACTGGAGACTCAGGACAGTCCAGGGAAACGGCAGC 1922
Query 1912 --------------------------TT---------------------------------------------- 1913
||
Sbjct 1923 AGTAAGTGGGAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTGCAACAACTCCCACCAGACGGGCCAGGCGAAGCCGT 1996
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 1997 TTCCCCTGGAGGAGAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTGACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCA 2070
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2071 GCTAGGGATGTTTCTGAAAAGAAAAAATCCAAGGATGTCTATCCCAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACAGC 2144
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2145 CGCCAGCACAGCGGGAAACGCCAGCTCACCCAGCACTGCTTCCCAGAGCCCGGACTTTGCAAGGACGGTGACCA 2218
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2219 GCAGCGGCTCTTCCGAGCCGAGCCCTCCAGAAGTAGATGTATCCAGGCAGTGTGTCTGCTCCCCTGGTGGGTCA 2292
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2293 GAGGACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGCTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCTCAGGCCCCA 2366
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2367 GGAGTCTCAAAGGAGAACTGGCAGGTGTTCTGATGAGGAGCGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATG 2440
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2441 GCGCGGATGGTACGAGATCCGCCTTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGAT 2514
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2515 GAGAGGACTAATGGGAGTGGCTGTGGGGCTACAGGTGAGGACAGGAGGGGGAGCTCCCAGCCTGAGAGTTGTGA 2588
Query 1914 -------------------------------------------------------------------------- 1913
Sbjct 2589 CGTGCAGTCTAATGAAGACTATCCTCGGAGGCCCCTAACCAGGGCCAGGAGCAGACTGTCCCATGTACCGCTGA 2662
Query 1914 -------GTCAGAAGTAGCCAAAACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACT 1980
|||||||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.
Sbjct 2663 TATCTGAGTCAGAAGTTGCCAAAACAAAGCCATGCCATGCCATGAAACGAAAGCGAACTGCAGATAAGTCTACC 2736
Query 1981 AGTACAAGTGATCCTGTGATCGAGGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGT 2054
||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2737 AGCACCAGTGACCCTGTGATTGAAGATGACCACGTACAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAAAATCTTGTTGGAGT 2810
Query 2055 CACTATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCA 2128
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 CACAATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTACTGAAAGACTGCCCCAAGATGATGTTCATCCATGCTACCA 2884
Query 2129 GGTGCAGGGTACTAAAACATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAG 2202
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885 GGTGCAGGGTACTGAAGCATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAG 2958
Query 2203 AAACTGAACATGGATCAGGTACTAGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACG 2276
|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2959 AAACTAAATATGGACCAGGTACTAGACCAAATACTGAGGATGCCTCCGGAGAGGAACCGGATCATCTACCTGCG 3032
Query 2277 CCCAATGCAGCAGGTGGACACTCTAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTA 2350
|||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3033 CCCAATGCAGCAGGTAGACACACTAACTCTGGAGCAGAAGCTCTTCAGCGGGCCCTACCCCTATCACATCTGCA 3106
Query 2351 TTATCCATGAATTCAGTAACCCTCCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCA 2424
|.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||.|||||.
Sbjct 3107 TCATCCACGAGTTCAGCAATCCTCCCAACGTGCGGAACAAGGTGCGCATCCGCAATTGGATGGACACGATAGCC 3180
Query 2425 AACATCAATCAAGAGCTCATTAAATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATA 2498
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||.|.||||||.||.||||||||.||
Sbjct 3181 AACATCAATCAAGAGCTCATTAAATACGAATTCTTCCTGGAAGCCACTCGGACTGAAGAGGATTTAAAGAAGTA 3254
Query 2499 CCCCAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTT 2572
|||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 3255 CCCTAAGTATCCCTGGGGGAGAGAAATCTACACTTTAGAGGGTGTTGTAGATGGAGCGCCGTATTCCATGATTT 3328
Query 2573 CTGACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGAT 2646
|.|||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.|||
Sbjct 3329 CCGACTTCCCTTGGCTGAGGTCACTGCGGACCGCAGAGCCCAACAGCTTTGCCAGATATGATTTTGAAGATGAT 3402
Query 2647 GAAGAAAGCACTATCTATGCTCCTAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGA 2720
|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 3403 GAAGAGAGCACCATCTATGCTCCTCGAAGAAAAGGGCAGTTGTCTGCAGACATTTGTATGGAGACAATAGGAGA 3476
Query 2721 GGAAATTTCAGAGATGCGTCAGATGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTG 2794
|||.||.|||||||||||.||||||||||.|||..||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 3477 GGAGATCTCAGAGATGCGCCAGATGAAGAGGGGCATATTTCAGCGAGTAGTAGCGATTTTTATCCACTACTGTG 3550
Query 2795 ATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGATGACTACATT 2829
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3551 ATGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGACGACTACATT 3585
