Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12761
• Subject: NM_001300761.3
• Aligned Length: 1503
• Identities: 955
• Gaps: 546

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATTCCGATGTTCACTGTAACATTGGAAGACTCTGGAACTCTGTGGAAAAGTCTTCACAGCTCCTCTGAATC  74

Query    1  ----ATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTT  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAAATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTT  148

Query   71  GCTCCTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAAT  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTCCTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAAT  222

Query  145  TTCAAAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCT  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAAAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCT  296

Query  219  GCGAGATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTG  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGAGATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTG  370

Query  293  CGAGAGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCAT  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAGAGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCAT  444

Query  367  TACCTGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTATATAATAACTTGTATGCTCTGGC  440
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACCTGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTACATAATAACTTGTATGCTCTGGC  518

Query  441  CTGTTACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGTTACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGC  592

Query  515  TGATCAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGT  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATCAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGT  666

Query  589  CAGCTTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGAC  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGAC  740

Query  663  AGGCCGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAG  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCCGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAG  814

Query  737  AAAATAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAA  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAATAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAA  888

Query  811  AAGATGGAAGCGGAAACCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAAC  884
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATGGAAGCGGAAGCCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAAC  962

Query  885  AGTCCTTGACACTTACTGT-AAATCTCCACAGACCTGGATGATGATCTCAGTCTGGGGAGAGGCTATGAAGCCA  957
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCCTTGACACTTACTGTAAAATCTCCACAGACCTGGATGATGATCTCAGTCTGGGGAGAGGCTATGAAGCCA  1036

Query  958  --------------------------------------------------------------------------  957
                                                                                      
Sbjct 1037  TAGCCAAGGTCCTGCAGAGCCAAGGAGAGATGACAGAAGCAATTAAATACTTGAAAAAATTTGTGAAAATTGCA  1110

Query  958  --------------------------------------------------------------------------  957
                                                                                      
Sbjct 1111  AGAAACAATTTTCAAAGCCTAGATTTGGTGAGAGCAAGTACAATGCTTGGGGACATCTACAATGAAAAAGGATA  1184

Query  958  --------------------------------------------------------------------------  957
                                                                                      
Sbjct 1185  CTACAACAAAGCTTCTGAATGCTTTCAGCAAGCTTTTGACACAACAGTAGAGCTAATGAGCATGCCTCTGATGG  1258

Query  958  --------------------------------------------------------------------------  957
                                                                                      
Sbjct 1259  ATGAGACAAAAGTTCACTATGGAATAGCAAAAGCTCATCAGATGATGCTTACAGTGAACAACTATATAGAGTCT  1332

Query  958  --------------------------------------------------------------------------  957
                                                                                      
Sbjct 1333  GCAGATCTCACCAGCCTCAACTACCTGCTGTCATGGAAGGAGAGCAGAGGTAACATTGAACCTGATCCAGTTAC  1406

Query  958  --------------------------------------------------------------------------  957
                                                                                      
Sbjct 1407  TGAAGAGTTTAGAGGATCCACAGTGGAAGCTGTATCTCAAAACTCAGAACGTTTGGAAGAACTCAGTAGGTTTC  1480

Query  958  -----------------------  957
                                   
Sbjct 1481  CAGGTGATCAAAAAAATGAAACT  1503