Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12761
- Subject:
- NM_001317806.2
- Aligned Length:
- 1422
- Identities:
- 955
- Gaps:
- 465
Alignment
Query 1 ATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTTGCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTTGCTC 74
Query 75 CTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAATTTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAATTTCA 148
Query 149 AAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCTGCGA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCTGCGA 222
Query 223 GATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTGCGAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTGCGAG 296
Query 297 AGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCATTACC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCATTACC 370
Query 371 TGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTATATAATAACTTGTATGCTCTGGCCTGT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTACATAATAACTTGTATGCTCTGGCCTGT 444
Query 445 TACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGCTGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGCTGAT 518
Query 519 CAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGTCAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGTCAGC 592
Query 593 TTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGACAGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGACAGGC 666
Query 667 CGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAGAAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAGAAAA 740
Query 741 TAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAAAAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAAAAGA 814
Query 815 TGGAAGCGGAAACCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAACAGTC 888
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAAGCGGAAGCCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAACAGTC 888
Query 889 CTTGACACTTACTGT-AAATCTCCACAGACCTGGATGATGATCTCAGTCTGGGGAGAGGCTATGAAGCCA---- 957
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTGACACTTACTGTAAAATCTCCACAGACCTGGATGATGATCTCAGTCTGGGGAGAGGCTATGAAGCCATAGC 962
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 963 CAAGGTCCTGCAGAGCCAAGGAGAGATGACAGAAGCAATTAAATACTTGAAAAAATTTGTGAAAATTGCAAGAA 1036
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1037 ACAATTTTCAAAGCCTAGATTTGGTGAGAGCAAGTACAATGCTTGGGGACATCTACAATGAAAAAGGATACTAC 1110
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1111 AACAAAGCTTCTGAATGCTTTCAGCAAGCTTTTGACACAACAGTAGAGCTAATGAGCATGCCTCTGATGGATGA 1184
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1185 GACAAAAGTTCACTATGGAATAGCAAAAGCTCATCAGATGATGCTTACAGTGAACAACTATATAGAGTCTGCAG 1258
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1259 ATCTCACCAGCCTCAACTACCTGCTGTCATGGAAGGAGAGCAGAGGTAACATTGAACCTGATCCAGTTACTGAG 1332
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1333 TTTAGAGGATCCACAGTGGAAGCTGTATCTCAAAACTCAGAACGTTTGGAAGAACTCAGTAGGTTTCCAGGTGA 1406
Query 958 ---------------- 957
Sbjct 1407 TCAAAAAAATGAAACT 1422