Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12837
• Subject: NM_028720.2
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1326
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCTGTGAGTCTGCGGCTCGGCGACTTGGTGTGGGGGAAACTGGGCCGGTATCCTCCCTGGCCAGGAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GATTGTTAATCCACCCAAGGACTTAAAGAAACCACGTGGAAAGAAATGCTTCTTTGTGAAGTTTTTTGGAACAG  148

Query    1  -----------------------------------------------------------ATGATAAAAATTAAC  15
                                                                       ||||||||.||||||
Sbjct  149  AAGATCATGCCTGGATCAAAGTGGAACAGCTAAAGCCTTACCATGCTCACAAGGAGGAGATGATAAAGATTAAC  222

Query   16  AAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGAC  89
            |||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGGTAAACGGTTCCAGCAAGCTGTGGATGCTGTTGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGAC  296

Query   90  GTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTG  163
            .||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCATCCCACACTTCTGCTGATGACAAGAATCGGCGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTG  370

Query  164  ATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGTCT  237
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  371  ATGAGAAACGCAAGCTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGACT  444

Query  238  TCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCG  311
            |||||||||.||||.|||||||||||||.|   ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGGCTCTGCAGACAGAGGCTCCAAATGC---CTTAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCG  515

Query  312  GCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGATGG  385
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  516  GCCCCCAAAGGATGAGAAGGACCTCACCATCCCTGAGTCTAGCACTGTAAAGGGGATGATGGCTGGACCGATGG  589

Query  386  CCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGCTA  459
            |.||.|||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.
Sbjct  590  CTGCATTTAAATGGCAGCCAACAGCGACCGAGCCAGTCAAAGATGCAGATCCTCATTTTCATCATTTTCTGTTG  663

Query  460  AGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGG  533
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACAAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGG  737

Query  534  CTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGGAT  607
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TTCCACCTCCATCCAGGCAGCAGACAGCACAGCTGTGAATGGCAGCATTACACCCACAGACAAAAAGATAGGAT  811

Query  608  TTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGG  681
            |||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  TTTTGGGCCTTGGCTTAATGGGAAGTGGCATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGG  885

Query  682  AACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGT  755
            |||||.||||||||||||                  |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AACCGGACTGCAGAGAAA------------------GAGGGGGCCCGCCTAGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGT  941

Query  756  CTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGTG  829
            .|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  942  TTCAACTTGTGACATCACTTTTGCCTGTGTGTCGGATCCAAAGGCAGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGCG  1015

Query  830  GTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTGAG  903
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1016  GTGTGCTGCAAGGAATCCGCCCCGGGAAGTGCTATGTGGACATGTCAACGGTGGATGCGGATACAGTCACCGAG  1089

Query  904  CTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCTAA  977
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1090  CTGGCCCAGGTGATTGTATCCAGAGGGGGACGCTTTCTGGAAGCACCAGTCTCAGGGAATCAGCAACTGTCCAA  1163

Query  978  TGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCGA  1051
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1164  TGATGGGATGTTGGTGATCTTAGCAGCCGGAGACAGGGGCTTGTATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCAA  1237

Query 1052  TGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCCAA  1125
            ||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1238  TGGGAAAGACCTCCTTCTTTTTAGGTGAAGTTGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATTGTGAACATGGTCCAA  1311

Query 1126  GGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTCTT  1199
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1312  GGGAGCTTCATGGCCACCATTGCTGAGGGGCTCACGCTGGCCCAAGTGACAGGCCAATCACAGCAGACACTCTT  1385

Query 1200  GGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAACT  1273
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1386  GGACATCCTTAATCAGGGACAATTGGCCAGCATCTTTCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTACAAGGAAACT  1459

Query 1274  TTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCAAC  1347
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct 1460  TTAAACCTGACTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCCTGGCCATTGCATTGGGTGATGCAGTCAAC  1533

Query 1348  CATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCCGACAACGA  1421
            ||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1534  CACCCCACTCCCATGGCAGCTGCAGCCAATGAGGTATACAAAAGAGCCAAGGCACTGGACCAGTCTGACAATGA  1607

Query 1422  TATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC  1452
            ||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608  TATGTCTGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC  1638