Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12837
- Subject:
- XM_017023786.2
- Aligned Length:
- 1809
- Identities:
- 1448
- Gaps:
- 360
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATCCCCGGCGGGCGCGGTGACGTCAGAGTAGCGGCGTGGCCAGTGACAGCCGGCCCCCGTCACGTGGTCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCCACTCCAATGGGCGGCGCCGGGGCGACTTGCTGTTCCCGGCGGCCCGTGCGTCGGCGGTGGTTGGGTGGTA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGATGGCGGCTGTGAGTCTGCGGCTCGGCGACTTGGTGTGGGGGAAACTCGGCCGATATCCTCCTTGGCCAGGA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AAGATTGTTAATCCACCAAAGGACTTGAAGAAACCTCGCGGAAAGAAATGCTTCTTTGTGAAATTTTTTGGAAC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGATAAAAATTA 13
|||||||||||||
Sbjct 297 AGAAGATCATGCCTGGATCAAAGTGGAACAGCTGAAGCCATATCATGCTCATAAAGAGGAAATGATAAAAATTA 370
Query 14 ACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAG 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAG 444
Query 88 ACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGG 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGG 518
Query 162 TGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGT 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGT 592
Query 236 CTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGT 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGT 666
Query 310 CGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGAT 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGAT 740
Query 384 GGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGC 814
Query 458 TAAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACT 888
Query 532 GGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGG 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGG 962
Query 606 ATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCT 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCT 1036
Query 680 GGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTC 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTC 1110
Query 754 GTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAG 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1111 GTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGAC---GTGCTGGGCCCCAG 1181
Query 828 TGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTG 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTG 1255
Query 902 AGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCT 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 AGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCT 1329
Query 976 AATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGC 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 AATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGC 1403
Query 1050 GATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCC 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 GATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCC 1477
Query 1124 AAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTC 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 AAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTC 1551
Query 1198 TTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAA 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 TTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAA 1625
Query 1272 CTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCA 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCA 1699
Query 1346 ACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCCGACAAC 1419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1700 ACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCTGACAAC 1773
Query 1420 GATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1806