Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12837
• Subject: XM_017023789.2
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1400
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGATAAAAATTAACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAAAAATTAACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAA  74

Query   75  AGGGAAAGACCAGACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGGAAAGACCAGACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTA  148

Query  149  GGCCAAACTCAGGTGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCAAACTCAGGTGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGA  222

Query  223  AAGAAGAGGGTGTCTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAAGAGGGTGTCTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCC  296

Query  297  CCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGA  370

Query  371  TGGCCGGACCGATGGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCCGGACCGATGGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTC  444

Query  445  CATCATTTCCTGCTAAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  445  CATCATTTCCTGCTAAGCCAAACAGAGA----------------------------------------------  472

Query  519  TGAAGAGGAAACTGGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAG  592
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  -----AGGAAACTGGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAG  541

Query  593  ACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  542  ACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCAC  615

Query  667  ACAGTGACTGTCTGGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  616  ACAGTGACTGTCTGGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAAC  689

Query  741  CCCCGCTGAAGTCGTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  690  CCCCGCTGAAGTCGTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGG  763

Query  815  TGCTGGGCCCCAGTGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  764  TGCTGGGCCCCAGTGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCT  837

Query  889  GACACCGTCACTGAGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838  GACACCGTCACTGAGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAA  911

Query  963  TCAGCAGCTGTCTAATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  TCAGCAGCTGTCTAATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCA  985

Query 1037  GCTGCTTCCAGGCGATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  GCTGCTTCCAGGCGATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATC  1059

Query 1111  GTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  GTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTC  1133

Query 1185  CCAGCAGACACTCTTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134  CCAGCAGACACTCTTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATA  1207

Query 1259  TCCTGCAAGGAAACTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208  TCCTGCAAGGAAACTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTG  1281

Query 1333  GGTGATGCGGTCAACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282  GGTGATGCGGTCAACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGA  1355

Query 1407  CCAGTCCGACAACGATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC  1452
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356  CCAGTCTGACAACGATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC  1401