Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12857
Subject:
NM_001281497.1
Aligned Length:
487
Identities:
415
Gaps:
41

Alignment

Query   1  ATGGCTGCCAAAGTGTTTGAGTCCATCGGCAAGTTTGGCCTGGCCTTAGCTGTTGCAGGAGGCATGGTGACCTC  74
           ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct   1  ATGGCTGCCAAAGTGTTTGAGTCCATTGGCAAGTTTGGCCTGGCCTTAGCTGTTGCAGGAGGCGTGGTGAACTC  74

Query  75  TGCCTTATGTAATGTGGATGCTGGGCACAGAGCTGCCATCTTTGACCAATTCCGTGGAGTACAGAACATTGTGG  148
           ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  75  TGCCTTATATAATGTGGATGCTGGGCACAGAGCTGTCATCTTTGACCGATTCCGTGGAGTGCAGGACATTGTGG  148

Query 149  TAGGGGAAGGGACTCACTTTCTCATCCCATGTGTACAAAAACCAATTATCTTTGACTGCTGTTCTCAACCACGT  222
           ||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 149  TAGGGGAAGGGACTCATTTTCTCATCCCGTGGGTACAGAAACCAATTATCTTTGACTGCCGTTCTCGACCACGT  222

Query 223  AGTGCGCCAGTCATCACTGGTAGCAAAGATTTACAGAATGTCAACATCACACTGTGCATCCTCTTCCGGCCCAT  296
           |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..|
Sbjct 223  AATGTGCCAGTCATCACTGGTAGCAAAGATTTACAGAATGTCAACATCACACTGCGCATCCTCTTCCGGCCTGT  296

Query 297  CACTAGCCAGCTTCCTCGCATCTTCACCAGCATTGGAGAGGACTACGATGAGTGTGTGCTGCCGTTCATTACCA  370
           |.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||.|||.||.|
Sbjct 297  CGCCAGCCAGCTTCCTCGCATCTTCACCAGCATCGGAGAGGACTATGATGAGCGTGTGCTGCCGTCCATCACAA  370

Query 371  CGGAGATCCTCAAGTCACTGGTGGCTCGCTTTGATGCTGGAGAACTAATCAC-------CCAGAGGGAGCTG--  435
           |.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||.||| ||.|  
Sbjct 371  CTGAGATCCTCAAGTCAGTGGTGGCTCGCTTTGATGCTGGAGAACTAATCACCTACCTGCCAGCGGG-GCAGTC  443

Query 436  -GT----CTCCAG-----CCAGGTGAGCAACAACCTTATGGAG  468
            ||    ||||||     ||||                     
Sbjct 444  CGTGCTCCTCCAGCTGCCCCAG---------------------  465