Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12859
Subject:
NM_032730.5
Aligned Length:
1188
Identities:
1062
Gaps:
126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAATTTCTGAAGACTTGTGTACTTAGAAGAAATGCATGCACTGCGGTTTGCTTCTGGAGAAGCAAAGTTGT  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGCCTGCTTGGGTGATAGATA  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAAAGCCTTCAGTTAGAAGGATTAGTACTACCTCTCCTAGGAGCACTGTCATGCCTGCTTGGGTGATAGATA  148

Query   23  AATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC  222

Query   97  ATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCTACAGCTTT  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCTACAGCTTT  296

Query  171  AAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT  370

Query  245  CTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT  444

Query  319  CCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGGTCTCTCACAAACCCAAATCACT  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGGTCTCTCACAAACCCAAATCACT  518

Query  393  CACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCTGCTATAAACAAAGTTGGTGGCC  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCTGCTATAAACAAAGTTGGTGGCC  592

Query  467  TGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGGCGGAGTTGGTACTTTTGCTATA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGGCGGAGTTGGTACTTTTGCTATA  666

Query  541  CAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATGCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCT  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATGCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCT  740

Query  615  TGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTGAAATCCTTAAAACCATTTGATT  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTGAAATCCTTAAAACCATTTGATT  814

Query  689  TTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCTCAAGAAATGGTCAGGAGCCACC  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCTCAAGAAATGGTCAGGAGCCACC  888

Query  763  TATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAGCAGATGGCATGTTGCAGACAGG  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAGCAGATGGCATGTTGCAGACAGG  962

Query  837  AGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTATCGCTGGGCATTTTTCATGGCCA  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTATCGCTGGGCATTTTTCATGGCCA  1036

Query  911  GTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAACAAACCTTT  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAACAAACCTTT  1110

Query  985  CCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCACGAGGAAAGACTGTAATTAATGT  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCACGAGGAAAGACTGTAATTAATGT  1184

Query 1059  TGTT  1062
            ||||
Sbjct 1185  TGTT  1188