Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12859
- Subject:
- NM_130892.5
- Aligned Length:
- 1188
- Identities:
- 946
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCGTTTTGAAGACCTGTGTACTTAGAAGAAGTGCTTGTGCCGCCGCCTGCTTCTGGAGAAGGACAGTTAT 74
Query 1 ----------------------------------------------------ATGCCTGCTTGGGTGATAGATA 22
|||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCAAAGCCACCATTTAGAGGCATTAGTACTACGTCTGCGAGGAGCACTGTCATGCCCGCTTGGGTGATAGATA 148
Query 23 AATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC 96
|||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AATATGGAAAGAATGAAGTCCTTCGATTCACCCAGAACATGATGTTACCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC 222
Query 97 ATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCTACAGCTTT 170
|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|
Sbjct 223 ATTATCAAAGTCCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGATGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCCACAGCCCT 296
Query 171 AAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT 244
||||||||||||||||||..|.||..||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATATGAAGCGTGATCCCCTGCATATGAAAACCAAAGGAGAAGAGTTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT 370
Query 245 CTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT 318
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGTGTGGTGATGGAGTGTGGGCTTGATGTGAAGTATTTCCAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT 444
Query 319 CCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGGTCTCTCACAAACCCAAATCACT 392
||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 445 CCTTGGAAGCAAGGCACTCTCTCAGAATTTGTTGTGGTCAGTGGGAATGAGGTTTCACACAAGCCCAAATCGCT 518
Query 393 CACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCTGCTATAAACAAAGTTGGTGGCC 466
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 TACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACGGCCTGGTCTGCCATAAACAAGGTTGGCGGCC 592
Query 467 TGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGGCGGAGTTGGTACTTTTGCTATA 540
|||.|||||.|||.||||..||.||.||||...|||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TGAGTGACAGGAACTGCAAGGGGAAGCGTGCCTTAATCTTGGGTGCGTCAGGTGGAGTTGGTACTTTTGCGATA 666
Query 541 CAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATGCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCT 614
|||||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 667 CAGGTAATGAAAGCATGGGGGGCTCATGTGACAGCCGTTTGCTCGAAAGATGCCAGTGAACTTGTGCGGAAGCT 740
Query 615 TGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTGAAATCCTTAAAACCATTTGATT 688
|||.|||||.||.||.||||||||||..|..|||||||||||||||||.||||||||..||||||..|||||.|
Sbjct 741 TGGAGCAGATGAGGTCATTGATTACACGTTGGGAAGTGTGGAAGAGCAATTGAAATCTCTAAAACTGTTTGACT 814
Query 689 TTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCTCAAGAAATGGTCAGGAGCCACC 762
|||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 815 TTATCCTTGATAACGTTGGTGGATCTACTGAAACATGGGCTCTAAATTTTCTCAAGAAGTGGTCAGGAGCTACC 888
Query 763 TATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAGCAGATGGCATGTTGCAGACAGG 836
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATGTGACTCTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGACTGGGTGTTGCTGATGGCATGTTGCAGACAGG 962
Query 837 AGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTATCGCTGGGCATTTTTCATGGCCA 910
||||||.||.|||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||..|.|||||.||.||||||||||
Sbjct 963 AGTCACCGTGGGTACAAAGGCATTGAAGCATCTCTGGCAAGGAGTCCATTACAGATGGGCCTTCTTCATGGCCA 1036
Query 911 GTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAACAAACCTTT 984
||||.||||.|.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..||.||.
Sbjct 1037 GTGGTCCATATCTAGATGAAATTGCAGAACTGGTGGATGCAGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAGCGGACATTC 1110
Query 985 CCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCACGAGGAAAGACTGTAATTAATGT 1058
|||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1111 CCTTTCTCTGAAGTCCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAGAGAGGCCACGCCCGAGGAAAGACTGTGGTTAATGT 1184
Query 1059 TGTT 1062
.|||
Sbjct 1185 AGTT 1188