Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12859
- Subject:
- XM_011536192.2
- Aligned Length:
- 1063
- Identities:
- 940
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ATGCCTGCTTGGGTGATAGATAAATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATACACTATCCAAATGAAGTCATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATAT-GAGA 147
||.| || ||| || |.|||.|.||.| ||| || ||.|
Sbjct 1 ----------------------ATGG-----GT--ACG--GC--GAGTACACCCGA-AGA-------ATCGAAA 33
Query 148 AGTGGTTATGGAGCTACAGCTTTAAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCC 221
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 GGTGGTTATGGAGCTACAGCTTTAAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCC 107
Query 222 TCTGACTCTGGGTCGGGATGTCTCTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAG 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 TCTGACTCTGGGTCGGGATGTCTCTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAG 181
Query 296 ATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCTCCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAG 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 ATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCTCCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAG 255
Query 370 GTCTCTCACAAACCCAAATCACTCACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTC 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 GTCTCTCACAAACCCAAATCACTCACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTC 329
Query 444 TGCTATAAACAAAGTTGGTGGCCTGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAG 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 TGCTATAAACAAAGTTGGTGGCCTGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAG 403
Query 518 GCGGAGTTGGTACTTTTGCTATACAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGAT 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 GCGGAGTTGGTACTTTTGCTATACAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGAT 477
Query 592 GCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCTTGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTT 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 GCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCTTGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTT 551
Query 666 GAAATCCTTAAAACCATTTGATTTTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTC 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 GAAATCCTTAAAACCATTTGATTTTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTC 625
Query 740 TCAAGAAATGGTCAGGAGCCACCTATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATA 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 TCAAGAAATGGTCAGGAGCCACCTATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATA 699
Query 814 GCAGATGGCATGTTGCAGACAGGAGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 700 GCAGATGGCATGTTGCAGACAGGAGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTA 773
Query 888 TCGCTGGGCATTTTTCATGGCCAGTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCC 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 TCGCTGGGCATTTTTCATGGCCAGTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCC 847
Query 962 GGCCAGTTATTGAACAAACCTTTCCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 848 GGCCAGTTATTGAACAAACCTTTCCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCA 921
Query 1036 CGAGGAAAGACTGTAATTAATGTTGTT 1062
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 922 CGAGGAAAGACTGTAATTAATGTTGTT 948