Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12917
• Subject: NM_033505.4
• Aligned Length: 1191
• Identities: 774
• Gaps: 417

Alignment

Query    1  ATGGCTGGCTACGAATACGTGAGCCCGGAGCAGCTGGCTGGCTTTGATAAGTACAAGTACAGTGCTGTGGATAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGCTACGAATACGTGAGCCCGGAGCAGCTGGCTGGCTTTGATAAGTACAAGTACAGTGCTGTGGATAC  74

Query   75  CAATCCACTTTCTCTGTATGTCATGCATCCATTCTGGAACACTATAGTAAAGGTATTTCCTACTTGGCTGGCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAATCCACTTTCTCTGTATGTCATGCATCCATTCTGGAACACTATAGTAAAGGTATTTCCTACTTGGCTGGCGC  148

Query  149  CCAATCTGATAACTTTTTCTGGCTTTCTGCTGGTCGTATTCAATTTTCTGCTAATGGCATACTTTGATCCTGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAATCTGATAACTTTTTCTGGCTTTCTGCTGGTCGTATTCAATTTTCTGCTAATGGCATACTTTGATCCTGAC  222

Query  223  TTTTATGCCTCAGCACCAGGTCACAAGCACGTGCCTGACTGGGTTTGGATTGTAGTGGGCATCCTCAACTTCGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTTATGCCTCAGCACCAGGTCACAAGCACGTGCCTGACTGGGTTTGGATTGTAGTGGGCATCCTCAACTTCGT  296

Query  297  AGCCTACACTCTAGATGGTGTGGACGGAAAGCAAGCTCGCAGAACCAATTCTAGCACTCCCTTAGGGGAGCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCTACACTCTAGATGGTGTGGACGGAAAGCAAGCTCGCAGAACCAATTCTAGCACTCCCTTAGGGGAGCTTT  370

Query  371  TTGATCATGGCCTGGATAGTTGGTCATGTGTTTACTTTGTTGTGACTGTTTATTCCATCTTTGGAAGAGGATCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGATCATGGCCTGGATAGTTGGTCATGTGTTTACTTTGTTGTGACTGTTTATTCCATCTTTGGAAGAGGATCA  444

Query  445  ACTGGTGTCAGTGTTTTTGTTCTTTATCTCCTGCTATGGGTAGTTTTGTTTTCTTTCATCCTGTCCCACTGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGGTGTCAGTGTTTTTGTTCTTTATCTCCTGCTATGGGTAGTTTTGTTTTCTTTCATCCTGTCCCACTGGGA  518

Query  519  AAAGTATAACACAGGGATTCTTTTCCTGCCATGGGGATATGACATTAGCCAGGTGACTATTTCTTTTGTCTACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAGTATAACACAGGGATTCTTTTCCTGCCATGGGGATATGACATTAGCCAGGTGACTATTTCTTTTGTCTACA  592

Query  593  TAGTGACTGCAGTTGTGGGAGTTGAGGCCTGGTATGAACCTTTCCTGTTTAATTTCTTATATAGAGACCTATTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGTGACTGCAGTTGTGGGAGTTGAGGCCTGGTATGAACCTTTCCTGTTTAATTTCTTATATAGAGACCTATTC  666

Query  667  ACTGCAATGATTATTGGTTGTGCATTATGTGTGACTCTTCCAATGAGTTTATTAAACTTTTT------------  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  667  ACTGCAATGATTATTGGTTGTGCATTATGTGTGACTCTTCCAATGAGTTTATTAAACTTTTTCAGAAGCTATAA  740

Query  729  --------------------------------------------------------------------------  728
                                                                                      
Sbjct  741  AAATAACACCTTGAAACTCAATTCAGTCTATGAAGCTATGGTTCCCTTATTTTCTCCATGCTTGCTGTTCATTT  814

Query  729  ------CAGCGTGGATCCTTTGGTCACCTTCAGATATTTTAGAGCTACATCC----------------------  774
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  815  TGTCTACAGCGTGGATCCTTTGGTCACCTTCAGATATTTTAGAGCTACATCCTAGAGTATTCTACTTTATGGTT  888

Query  775  --------------------------------------------------------------------------  774
                                                                                      
Sbjct  889  GGAACAGCTTTTGCCAACAGTACATGTCAGCTGATTGTTTGCCAAATGAGTAGTACCCGGTGTCCAACTTTGAA  962

Query  775  --------------------------------------------------------------------------  774
                                                                                      
Sbjct  963  TTGGTTGCTGGTTCCTCTCTTCTTGGTTGTCTTAGTGGTAAACCTAGGAGTAGCCTCTTACGTTGAGAGCATTC  1036

Query  775  --------------------------------------------------------------------------  774
                                                                                      
Sbjct 1037  TCCTGTATACATTAACAACTGCTTTTACTCTGGCCCACATCCATTATGGAGTACGAGTGGTAAAGCAGCTGAGC  1110

Query  775  --------------------------------------------------------------------------  774
                                                                                      
Sbjct 1111  AGCCATTTTCAGATTTACCCCTTCTCATTGAGGAAACCAAACTCAGATTGACTAGGAATGGAAGAAAAGAATAT  1184

Query  775  -------  774
                   
Sbjct 1185  TGGCCTG  1191