Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12945
- Subject:
- NM_001300757.1
- Aligned Length:
- 1125
- Identities:
- 858
- Gaps:
- 267
Alignment
Query 1 ATGTCCTATAATATACTTTCACAAGATTTACTGGAAGATAACTCTCACCTTTATAGACATTGCCGGCGGCCAGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCTATAATATACTTTCACAAGATTTACTGGAAGATAACTCTCACCTTTATAGACATTGCCGGCGGCCAGT 74
Query 75 ATTACACTGGAGTTTTAGGTTTCCCAATATTCTGAAAGAAATTAAACATTTTGATGCAGACGTACTTTGTTTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATTACACTGGAGTTTTAGGTTTCCCAATATTCTGAAAGAAATTAAACATTTTGATGCAGACGTACTTTGTTTGC 148
Query 149 AAGAAGTTCAAGAAGATCATTATGGAGCAGAGATCAGGCCAAGTTTGGAATCACTGGGTTATCACTGTGAATAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAAGTTCAAGAAGATCATTATGGAGCAGAGATCAGGCCAAGTTTGGAATCACTGGGTTATCACTGTGAATAT 222
Query 223 AAGATGCGGACAGGAAGGAAACCTGATGGCTGTGCTATTTGCTTCAAACATTCCAAATTTTCACTCTTGTCAGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGATGCGGACAGGAAGGAAACCTGATGGCTGTGCTATTTGCTTCAAACATTCCAAATTTTCACTCTTGTCAGT 296
Query 297 GAACCCAGTGGAATTCTTCCGCCCTGATATTTCTCTGTTGGACAGAGACAATGTTGGATTAGTTTTACTCTTAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAACCCAGTGGAATTCTTCCGCCCTGATATTTCTCTGTTGGACAGAGACAATGTTGGATTAGTTTTACTCTTAC 370
Query 371 AGCCCAAAATTCCATATGCTGCCTGCCCTGCAATCTGCGTAGCAAATACGCATCTGTTGTATAATCCAAGGCGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCCCAAAATTCCATATGCTGCCTGCCCTGCAATCTGCGTAGCAAATACGCATCTGTTGTATAATCCAAGGCGA 444
Query 445 GGTGATATTAAGCTGACGCAATTGGCAATGCTACTGGCAGAGATTTCCAGTGTTGCCCACCAGAAAGATGGCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTGATATTAAGCTGACGCAATTGGCAATGCTACTGGCAGAGATTTCCAGTGTTGCCCACCAGAAAGATGGCAG 518
Query 519 CTTCTGCCCTATTGTTATGTGTGGTGACTTTAATTCTGTTCCTGGTTCTCCACTATATAGTTTCATAAAGGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTCTGCCCTATTGTTATGTGTGGTGACTTTAATTCTGTTCCTGGTTCTCCACTATATAGTTTCATAAAGGAAG 592
Query 593 GAAAATTGAATTATGAAGGACTTCCCATAGGAAAGGTATCTGGCCAGGAACAGTCTTCACGGGGACAAAGAATT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAAATTGAATTATGAAGGACTTCCCATAGGAAAGGTATCTGGCCAGGAACAGTCTTCACGGGGACAAAGAATT 666
Query 667 TTATCTATTCCAATTTGGCCCCCAAACCTAGGTATCTCACAGAACTGTGTGTATGAGGTACAGCAGGTACCAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTATCTATTCCAATTTGGCCCCCAAACCTAGGTATCTCACAGAACTGTGTGTATGAGGTACAGCAGGTACCAAA 740
Query 741 AGTAGAAAAGACAGACAGTGATCTGACACAAACACAGCTGAAGCAAACAGAGGTCCTAGTGACAGCTGAAAAAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTAGAAAAGACAGACAGTGATCTGACACAAACACAGCTGAAGCAAACAGAGGTCCTAGTGACAGCTGAAAAAT 814
Query 815 TGTCTTCAAATTTACAGCACCATTTCAGTTTGTCATCTGTTTAT------------------------------ 858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTCTTCAAATTTACAGCACCATTTCAGTTTGTCATCTGTTTATTCACATTACTTTCCTGACACTGGAATTCCA 888
Query 859 -------------------------------------------------------------------------- 858
Sbjct 889 GAAGTGACCACCTGTCATTCCCGAAGTGCCATAACTGTGGATTATATTTTCTACTCTGCAGAAAAGGAAGATGT 962
Query 859 -------------------------------------------------------------------------- 858
Sbjct 963 TGCTGGGCACCCAGGAGCTGAAGTTGCTTTGGTTGGTGGCTTGAAACTTCTAGCTAGACTGTCACTTCTTACAG 1036
Query 859 -------------------------------------------------------------------------- 858
Sbjct 1037 AACAAGACTTATGGACTGTTAATGGACTTCCAAACGAAAATAACTCTTCAGATCATCTGCCTTTATTGGCAAAG 1110
Query 859 --------------- 858
Sbjct 1111 TTCAGACTTGAGCTC 1125