Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12965
- Subject:
- NM_001172309.1
- Aligned Length:
- 1833
- Identities:
- 1701
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGATATTTCCCAAAAGGCTGAGATTAAAGAAATGCTTGCTTCTGATGATGAGGAAGATGTATCTTCTAA 74
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGGAGAAACAAAGAC 16
||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTAGAAAAGGCTTATGTTCCAAAATTAACAGGAACTGTGAAGGGTAGATTTGCTGAAATGGAGAAACAAAGAC 148
Query 17 AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA 222
Query 91 ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGA 164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGA 296
Query 165 GGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGA 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGA 370
Query 239 ATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATAT 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATAT 444
Query 313 GAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGC 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGC 518
Query 387 AAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACC 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACC 592
Query 461 GAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGG 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGG 666
Query 535 CAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAA 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAA 740
Query 609 ACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGA 682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGA 814
Query 683 GAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATG 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATG 888
Query 757 TATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAA 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAA 962
Query 831 AATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAAC 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAAC 1036
Query 905 AACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTG 978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTG 1110
Query 979 ATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTC 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTC 1184
Query 1053 TGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGC 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGC 1258
Query 1127 GAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACT 1332
Query 1201 CACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGA 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGA 1406
Query 1275 AGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGG 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGG 1480
Query 1349 AGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCA 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCA 1554
Query 1423 TGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGG 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGG 1628
Query 1497 AGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTG 1570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTG 1702
Query 1571 AAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCA 1644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCA 1776
Query 1645 GTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACCATTGAAAGTAAGAAT 1701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACCATTGAAAGTAAGAAT 1833