Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12965
• Subject: XM_005271322.4
• Aligned Length: 2028
• Identities: 1698
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGATATTTCCCAAAAGGCTGAGATTCTGCTTTCTTCATCTAAACCTGTCCCAAAAACCTATGTACCAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACTTGGCAAGGGTGATGTAAAGGATAAGTTTGAAGCCATGCAGAGAGCCAGGGAAGAAAGAAATCAAAGGAGAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CTAGAGACGAAAAACAAAGAAGAAAAGAACAATATATTAGAGAGAGAGAATGGAACAGGAGAAAGCAGGAGATT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAAGAAATGCTTGCTTCTGATGATGAGGAAGATGTATCTTCTAAAGTAGAAAAGGCTTATGTTCCAAAATTAAC  296

Query    1  ----------------------------ATGGAGAAACAAAGACAAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGG  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGAACTGTGAAGGGTAGATTTGCTGAAATGGAGAAACAAAGACAAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGG  370

Query   47  AACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAAATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAAATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAA  444

Query  121  CAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGAGGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGT  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGAGGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGT  518

Query  195  GGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGAATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAG  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGAATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAG  592

Query  269  AGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATATGAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCA  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATATGAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCA  666

Query  343  AAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGCAAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATT  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGCAAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATT  740

Query  417  GAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACCGAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAA  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACCGAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAA  814

Query  491  AACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGGCAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAA  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGGCAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAA  888

Query  565  GACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAAACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAG  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAAACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAG  962

Query  639  AAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGAGAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGAGAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTG  1036

Query  713  AAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATGTATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACA  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATGTATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACA  1110

Query  787  CCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAAAATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAAAATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGA  1184

Query  861  GGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAACAACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAACAACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGG  1258

Query  935  AAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTGATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAA  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTGATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAA  1332

Query 1009  GCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTCTGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTCTGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGA  1406

Query 1083  AGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGCGAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATG  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGCGAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATG  1480

Query 1157  ATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACTCACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAA  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACTCACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAA  1554

Query 1231  CAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGAAGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGA  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGAAGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGA  1628

Query 1305  ACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATG  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATG  1702

Query 1379  GCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCATGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCA  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCATGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCA  1776

Query 1453  GTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGGAGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTT  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGGAGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTT  1850

Query 1527  TGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTGAAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTAC  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTGAAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTAC  1924

Query 1601  CAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCAGTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCAGTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACC  1998

Query 1675  TGTATTCTTACCATTGAAAGT-AAGAAT--  1701
            |||||||||||||||||||.| |.||.|  
Sbjct 1999  TGTATTCTTACCATTGAAACTGATGACTAC  2028