Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12966
- Subject:
- XM_005271326.4
- Aligned Length:
- 1794
- Identities:
- 1661
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGATATTTCCCAAAAGGCTGAGATTAAAGAAATGCTTGCTTCTGATGATGAGGAAGATGTATCTTCTAA 74
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGGAGAAACAAAGAC 16
||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTAGAAAAGGCTTATGTTCCAAAATTAACAGGAACTGTGAAGGGTAGATTTGCTGAAATGGAGAAACAAAGAC 148
Query 17 AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA 222
Query 91 ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAA 164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAA 296
Query 165 ATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGAATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGA 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGAATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGA 370
Query 239 TCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATATGAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCA 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATATGAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCA 444
Query 313 TTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGCAAAAAAAGAATCACTTTCTCCCAGAAAATTGAAACTAACTTT 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGCAAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTT 518
Query 387 TGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACCGAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAG 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACCGAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAG 592
Query 461 AAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGGCAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAA 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGGCAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAA 666
Query 535 ATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAAACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGA 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAAACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGA 740
Query 609 AAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGAGAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAA 682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGAGAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAA 814
Query 683 ATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATGTATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTG 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATGTATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTG 888
Query 757 GAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAAAATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCA 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAAAATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCA 962
Query 831 TAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAACAACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAA 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAACAACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAA 1036
Query 905 CCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTGATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTA 978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTGATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTA 1110
Query 979 AAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTCTGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAG 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTCTGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAG 1184
Query 1053 AAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGCGAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTA 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGCGAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTA 1258
Query 1127 GGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACTCACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACTCACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAG 1332
Query 1201 GCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGAAGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAAT 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGAAGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAAT 1406
Query 1275 TGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTG 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTG 1480
Query 1349 AAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCATGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGT 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCATGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGT 1554
Query 1423 GAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGGAGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAAT 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGGAGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAAT 1628
Query 1497 ACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTGAAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCC 1570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTGAAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCC 1702
Query 1571 CAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCAGTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACC 1644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCAGTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACC 1776
Query 1645 ATTGAAACTGATGACTAC 1662
||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATTGAAACTGATGACTAC 1794