Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12989
• Subject: NM_001286829.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1502
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGAGCAGGACCCCGAGGCGCGCGCGGCGGCGCGGCCGCTGCTCACTGACCTCTACCAGGCCACCAT  74

Query    3  GGCGTTGGGCTATTGGCGCGCGGGCCGGGCGCGGGACGCCGCCGAGTTCGAGCTCTTCTTCCGCCGCTGCCCGT  76
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGTTGGGCTATTGGCGCGCGGGCCGGGCGCGGGACGCCGCCGAGTTCGAGCTCTTCTTCCGCCGCTGCCCGT  148

Query   77  TCGGCGGCGCCTTCGCCTTGGCCGCCGGCTTGCGCGACTGTGTGCGCTTCCTGCGCGCCTTCCGCCTGCGGGAC  150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCGGCGGCGCCTTCGCCTTGGCCGCCGGCTTGCGCGACTGTGTGCGCTTCCTGCGCGCCTTCCGCCTGCGGGAC  222

Query  151  GCCGACGTGCAGTTCCTGGCCTCGGTGCTGCCCCCAGACACGGATCCTGCGTTCTTCGAGCACCTTCGGGCCCT  224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCGACGTGCAGTTCCTGGCCTCGGTGCTGCCCCCAGACACGGATCCTGCGTTCTTCGAGCACCTTCGGGCCCT  296

Query  225  CGACTGCTCCGAGGTGACGGTGCGAGCCCTGCCCGAGGGCTCCCTCGCCTTCCCCGGAGTGCCGCTCCTGCAGG  298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGACTGCTCCGAGGTGACGGTGCGAGCCCTGCCCGAGGGCTCCCTCGCCTTCCCCGGAGTGCCGCTCCTGCAGG  370

Query  299  TGTCCGGGCCGCTCCTGGTGGTGCAGCTGCTGGAGACACCGCTGCTCTGCCTGGTCAGCTACGCCAGCCTGGTG  372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCCGGGCCGCTCCTGGTGGTGCAGCTGCTGGAGACACCGCTGCTCTGCCTGGTCAGCTACGCCAGCCTGGTG  444

Query  373  GCCACCAACGCAGCGCGGCTTCGCTTGATCGCAGGGCCAGAGAAGCGGCTGCTAGAGATGGGCCTGAGGCGGGC  446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCACCAACGCAGCGCGGCTTCGCTTGATCGCAGGGCCAGAGAAGCGGCTGCTAGAGATGGGCCTGAGGCGGGC  518

Query  447  TCAGGGCCCCGATGGGGGCCTGACAGCCTCCACCTACAGCTACCTGGGCGGCTTCGACAGCAGCAGCAACGTGC  520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGGGCCCCGATGGGGGCCTGACAGCCTCCACCTACAGCTACCTGGGCGGCTTCGACAGCAGCAGCAACGTGC  592

Query  521  TAGCGGGCCAGCTGCGAGGTGTGCCGGTGGCCGGGACCCTGGCCCACTCCTTCGTCACTTCCTTTTCAGGCAGC  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGCGGGCCAGCTGCGAGGTGTGCCGGTGGCCGGGACCCTGGCCCACTCCTTCGTCACTTCCTTTTCAGGCAGC  666

Query  595  GAGGTGCCCCCTGACCCGATGTTGGCGCCAGCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCA  668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGTGCCCCCTGACCCGATGTTGGCGCCAGCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCA  740

Query  669  GGTGTGGCTGGAGCAGGTGTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCGCATCCAGGCGAGCGGGCAGCCT  742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGTGGCTGGAGCAGGTGTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCGCATCCAGGCGAGCGGGCAGCCT  814

Query  743  TTGTGGCCTATGCCTTGGCTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGT  816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTGGCCTATGCCTTGGCTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGT  888

Query  817  CTCCCCAACTTCCTAGCAGTCGCCTTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAG  890
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCCCAACTTCCTAGCAGTCGCCCTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAG  962

Query  891  TGGTGACCTGCTACAGCAGGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCT  964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGACCTGCTACAGCAGGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCT  1036

Query  965  GGCTGGAGTCAGTCCTCATCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGGAGGGC  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCTGGAGTCAGTCCTCATCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGGAGGGC  1110

Query 1039  AGTGAGGTGAATGTCATTGGCATTGGCACCAGTGTGGTCACCTGCCCCCAACAGCCTTCCCTGGGTGGCGTCTA  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGAGGTGAATGTCATTGGCATTGGCACCAGTGTGGTCACCTGCCCCCAACAGCCTTCCCTGGGTGGCGTCTA  1184

Query 1113  TAAGCTGGTGGCCGTGGGGGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGA  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAAGCTGGTGGCCGTGGGGGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGA  1258

Query 1187  GCAAGGCTGCTTTCCGGCTCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCA  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCAAGGCTGCTTTCCGGCTCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCA  1332

Query 1261  GTGCCACAGGCTGGGCAGGAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCA  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1333  GTGCCACAGGCTGGGCAGGAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCC--  1404

Query 1335  GGTGGAGCCACTACTGCGGCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGCTGTGTGAGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAGTCTA  1408
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  -------------------------------------CAGCTGTGTGAGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAGTCTA  1441

Query 1409  GAGCCTTGGCCCAGCTGTCCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTACCAG  1482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442  GAGCCTTGGCCCAGCTGTCCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTACCAG  1515

Query 1483  GTGGTGCTGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCC  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516  GTGGTGCTGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCC  1575