Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12996
- Subject:
- XM_017016931.1
- Aligned Length:
- 2231
- Identities:
- 1930
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCAGCTTCACATTCCGGATATCTTTATGTTGGGGAAAATGTTTCAAAGGTACAAAACTCAAAACATGAACA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACAATATATATTACCAATCTTCAAACCTGGTTTGCCTAGAACTGGAATACAGTTGCCTGCGACATATTTTAGAA 148
Query 1 --------------------ATGG--AACTTGAAAATG-------ATTATTGCTTGAATGATTACAACAT---- 41
|||| ||| .||||| | ||| |||.||||||.|.|||||
Sbjct 149 GAACTAGAAAAGTCAAAGTAATGGATAAC-AGAAAA-GAGCCTCCATT----CTTCAATGATGATAACATGGGA 216
Query 42 ---------TTCAGA---------------AGGGTGGA------CCTTGAAGC--TA----------GTTTTG- 72
|.|||| |...|||| |.|||||.| || ||||||
Sbjct 217 CCATTTTACTACAGACTTCATTTCTGTGATACCATGGAGCTCTTCATTGAAACATTAACTGGAACATGTTTTGA 290
Query 73 GCTATGCGTGGCGGACCTAT------------------------AAATACTAGAAG------AGTTCCTACAGA 116
|||..|.||..| ||||.| |||.|.|.|||| ||||||||||||
Sbjct 291 GCTGAGAGTTTC--ACCTTTTGAAACTGTTATTTCTGTGAAAGCAAAAATTCGAAGATTGGAAGTTCCTACAGA 362
Query 117 CGATCCACTTAGGACGATGGCAGAGTACTTGGATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCA 190
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CGATCCACTTAGGAAGATGGCAGAGTACTTGGATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCA 436
Query 191 AACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGC 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGC 510
Query 265 ACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAAAATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACA 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 ACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAAAATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACA 584
Query 339 TCGTATG------------------AGTGGTGGTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTG 394
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 TCGTATGAGTTATTGTTTTCTTTGCAGTGGTGGTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTG 658
Query 395 AGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAAAATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAG 468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAAAATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAG 732
Query 469 ATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAAGAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCG 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 ATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAAGAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCG 806
Query 543 ACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCCACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTT 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 ACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCCACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTT 880
Query 617 CACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAAATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCT 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAAATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCT 954
Query 691 GCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGAATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTC 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGAATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTC 1028
Query 765 TCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTCAGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTG 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTCAGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTG 1102
Query 839 ACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCTAGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAAT 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 ACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCTAGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAAT 1176
Query 913 GGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGTAACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTC 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 GGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGTAACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTC 1250
Query 987 ATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCAGCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTAC 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 ATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCAGCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTAC 1324
Query 1061 TCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCAGAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAA 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 TCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCAGAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAA 1398
Query 1135 TCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGAATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTG 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 TCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGAATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTG 1472
Query 1209 TTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGGTGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGC 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 TTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGGTGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGC 1546
Query 1283 TACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTTCAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTT 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 TACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTTCAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTT 1620
Query 1357 CAAGGTGTTAAAGTTGATTCGCTTGGGAAAAGATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGA 1430
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGGAAAAGATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGA 1694
Query 1431 AATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTGGTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGA 1504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 AATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTGGTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGA 1768
Query 1505 GCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGTGGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACA 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 GCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGTGGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACA 1842
Query 1579 AACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAGGAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTC 1652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 AACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAGGAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTC 1916
Query 1653 TACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATGCAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACC 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATGCAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACC 1990
Query 1727 TCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAGAAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 TCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAGAAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACA 2064
Query 1801 GGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGGAAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGG 1874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGGAAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGG 2138
Query 1875 CTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGAGATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGC 1948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 CTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGAGATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGC 2212
Query 1949 TTCCAAAAATC 1959
|||||||||||
Sbjct 2213 TTCCAAAAATC 2223