Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12996
• Subject: XM_017016932.1
• Aligned Length: 2199
• Identities: 1956
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATAACAGAAAAGAGCCTCCATTCTTCAATGATGATAACATGGGACCATTTTACTACAGACTTCATTTCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGATACCATGGAGCTCTTCATTGAAACATTAACTGGAACATGTTTTGAGCTGAGAGTTTCACCTTTTGAAACTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TTATTTCTGTGAAAGCAAAAATTCGAAGATTGGAAGGTATTCCCATCTGTCGACAACACTTAATTTGGAATAAC  222

Query    1  ATGGAACTTGAAAATGATTATTGCTTGAATGATTACAACATTTCAGAAGGGTGGACCTTGAAGCTAGTTTTGGC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGGAACTTGAAAATGATTATTGCTTGAATGATTACAACATTTCAGAAGGGTGTACCTTGAAGCTAGTTTTGGC  296

Query   75  TATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGACGATGGCAGAGTACTTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  297  TATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGAAGATGGCAGAGTACTTGG  370

Query  149  ATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGA  444

Query  223  GATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAA  518

Query  297  AATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATG------------------AGTGGTG  352
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||
Sbjct  519  AATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAGTTATTGTTTTCTTTGCAGTGGTG  592

Query  353  GTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAA  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAA  666

Query  427  AATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAA  740

Query  501  GAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCC  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCC  814

Query  575  ACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAA  888

Query  649  ATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGA  962

Query  723  ATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTC  1036

Query  797  AGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCT  1110

Query  871  AGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGT  1184

Query  945  AACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCA  1258

Query 1019  GCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCA  1332

Query 1093  GAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGA  1406

Query 1167  ATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGG  1480

Query 1241  TGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTT  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTT  1554

Query 1315  CAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCGCTTGGGAAAAG  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555  CAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGGAAAAG  1628

Query 1389  ATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTG  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTG  1702

Query 1463  GTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGT  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGT  1776

Query 1537  GGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAG  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAG  1850

Query 1611  GAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATG  1684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATG  1924

Query 1685  CAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAG  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAG  1998

Query 1759  AAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGG  1832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGG  2072

Query 1833  AAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA  1906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA  2146

Query 1907  GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  1959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  2199