Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13007
• Subject: XM_011516710.3
• Aligned Length: 1119
• Identities: 798
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  ATGTCCCTCCGGAGGCACATTGGGAACCCTGAGTATCTGATGAAAAGGATACCACAGAACCCAAGATACCAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TATCAAATCAAGACTGGACACTGGTAACAGTATGACTAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATT  148
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------ATGACTAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATT  43

Query  149  ATAGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTACAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  ATAGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTACAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCT  117

Query  223  TCCCTCTCTGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGGCTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  TCCCTCTCTGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGGCTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTC  191

Query  297  AGACCCTGATGCTGAAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGAGCAGTCGCCGAGCCCTGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  AGACCCTGATGCTGAAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGAGCAGTCGCCGAGCCCTGAGC  265

Query  371  AGTTCATAAACAACGCAGGAGCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCAGTGGTGTTGGGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  AGTTCATAAACAACGCAGGAGCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCAGTGGTGTTGGGGAA  339

Query  445  CTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAAGAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGACTGCCCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  CTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAAGAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGACTGCCCCTT  413

Query  519  CCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTTACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAATTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  CCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTTACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAATTG  487

Query  593  CAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGATATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  CAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGATATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATC  561

Query  667  ATTCTGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCACCACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  ATTCTGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCACCACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCT  635

Query  741  CTTCATGCTTTCCGGAG---------------------------------------------------------  757
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  636  CTTCATGCTTTCCGGAGGTCTAAAAGTCTTAGCTCAGAAATTCCCGGAAGGACTGATTACTGGTTCCCTGCCAG  709

Query  758  --------------------------------------------------------------------------  757
                                                                                      
Sbjct  710  CATCTTGCCAGCAGGCCCTTCCTCCTGGGTCTGCCCGGAAACGATCCAGCCCCAAAGGGCCACCCCTACCAGCT  783

Query  758  --------------------------------------------------------------------------  757
                                                                                      
Sbjct  784  GAGAATAAATGGAGATTTACCCCAGAAGACTTAAAAAAGATAGAATATTATCTGGAAGAGGAGCAAGGGCCTGC  857

Query  758  -----------GCCGACTGAACCAAGCTAACTCCTCCGGAAGAGAGTCCAAGGTGCCTGGTGCCCGAAGCGCTC  820
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  AGATCATCCTAGCCGACTGAACCAAGCTAACTCCTCCGGAAGAGAGTCCAAGGTGCCTGGTGCCCGAAGCGCTC  931

Query  821  AGAATCTGCCAGGTGGCGGCCCCGCCAGCCACTCAAACCCCCGCTCCCTCAGCAGTGGTCACCTGCAAGGCAAA  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  AGAATCTGCCAGGTGGCGGCCCCGCCAGCCACTCAAACCCCCGCTCCCTCAGCAGTGGTCACCTGCAAGGCAAA  1005

Query  895  CCCTGGAAG  903
            |||||||||
Sbjct 1006  CCCTGGAAG  1014