Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13020
- Subject:
- NM_001170808.1
- Aligned Length:
- 1960
- Identities:
- 1121
- Gaps:
- 839
Alignment
Query 1 ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT 74
Query 75 TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT 148
Query 149 CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA 222
Query 223 TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT 296
Query 297 GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA 370
Query 371 AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT 444
Query 445 GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT 518
Query 519 TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC 592
Query 593 GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA 666
Query 667 AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA 740
Query 741 TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA 814
Query 815 AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA 888
Query 889 ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG 962
Query 963 TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA 1036
Query 1037 GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC 1110
Query 1111 C-AAAAAATCGTG------------------------------------------------------------- 1122
| ||||||||| |
Sbjct 1111 CAAAAAAATCG-GAGAACTCTCTTCAGAGGTCGAAGACGACGAGAAGATGACAGGATCTCAAGACCTCATCCTT 1183
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1184 CAACAGCTGAATCAAAGGCTCCAACACCAAAGTTTGACTTATTAGCCTCAAATTTTCCACCTTTACCTGGAAGT 1257
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1258 TCATCAAGAATGCCAGGTGAACTCGTTTTGGAGAATAGGATGTCTGATGTTGTTAAAGGTGTCTACAAAGAAAA 1331
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1332 GGATAATGAAGAGTTGACAATTAGTTGCCCAGTGCCTGCAGATGAGCAGACAGAATGCACTTCTGCCCAGCAAC 1405
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1406 TCAATATGAGTACCAGTTCTCCATGTGCTGCTGAGCTTACTGCATTAAGCACAACTCAGCAAGAAAAGGATCTA 1479
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1480 ATAGAAGATTCCTCTGTTCAGAAGGATGGTCTCAATCAGACAACTATACCAGTTTCTCCTCCAAGTACTACAAA 1553
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1554 GCCATCGAGGGCAAGTACTGCTTCACCATGTAATAATAACATAAATGCAGCTACAGCTGTGGCTCTACAGGAAC 1627
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1628 CCCGAAAGTTAAGTTATGCTGAAGTGTGCCAGAAGCCCCCTAAAGAGCCATCTTCAGTTCTTGTGCAGCCACTA 1701
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1702 CGGGAACTTCGCTCCAATGTGGTGTCTCCCACCAAAAATGAAGACAATGGAGCTCCTGAGAACTCCGTTGAGAA 1775
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1776 ACCACATGAGAAGCCAGAAGCAAGGGCTAGTAAGGATTATTCTGGCTTCCGAGGCAATATAATCCCCAGGGGAG 1849
Query 1123 -------------------------------------------------------------------------- 1122
Sbjct 1850 CAGCAGGAAAAATCAGGGAACAGAGACGCCAGTTTAGCCATAGGGCTATACCTCAGGGAGTGACTCGACGTAAT 1923
Query 1123 ------------------------------------ 1122
Sbjct 1924 GGCAAAGAGCAATATGTGCCACCCAGATCACCAAAG 1959
