Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13020
• Subject: NM_001352323.2
• Aligned Length: 1462
• Identities: 1121
• Gaps: 341

Alignment

Query    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74

Query   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148

Query  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222

Query  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296

Query  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370

Query  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444

Query  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518

Query  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592

Query  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666

Query  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740

Query  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  814

Query  815  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  888

Query  889  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  962

Query  963  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  1036

Query 1037  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  1110

Query 1111  C-AAAAAATCGTG-------------------------------------------------------------  1122
            | ||||||||| |                                                             
Sbjct 1111  CAAAAAAATCG-GAGAACTCTCTTCAGAGGTCGAAGACGACGAGAAGATGACAGGATCTCAAGACCTCATCCTT  1183

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1184  CAACAGCTGAATCAAAGGCTCCAACACCAAAGTTTGACTTATTAGCCTCAAATTTTCCACCTTTACCTGGAAGT  1257

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1258  TCATCAAGAATGCCAGGTGAACTCGTTTTGGAGAATAGGATGTCTGATGTTGTTAAAGGTGTCTACAAAGAAAA  1331

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1332  GCACAACTCAGCAAGAAAAGGATCTAATAGAAGATTCCTCTGTTCAGAAGGATGGTCTCAATCAGACAACTATA  1405

Query 1123  --------------------------------------------------------  1122
                                                                    
Sbjct 1406  CCAGTTTCTCCTCCAAGTACTACAAAGCCATCGAGGGCAAGTACTGCTTCACCATG  1461