Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13020
• Subject: NM_001352326.2
• Aligned Length: 1123
• Identities: 907
• Gaps: 215

Alignment

Query    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74

Query   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148

Query  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222

Query  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296

Query  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370

Query  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444

Query  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518

Query  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592

Query  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666

Query  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740

Query  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTA------------  802

Query  815  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  888
                                                                                      
Sbjct  803  --------------------------------------------------------------------------  802

Query  889  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  962
                                                                                      
Sbjct  803  --------------------------------------------------------------------------  802

Query  963  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  1036
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  803  -----------------------------------------------------TGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  823

Query 1037  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  897

Query 1111  C-AAAAAATCGTG  1122
            | |||||||||. 
Sbjct  898  CAAAAAAATCGG-  909