Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13049
• Subject: NM_001111270.3
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1420
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGCCCCCGGACCGCCCCGCCCCTGGCCGCACTGACCGGATACTGGGGGTCATGGGGGGCATGCTGCGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATGCGCCCTCCCTGGGCAGGAGGGGCCCCCAAGGAGAAGCCCTCTAGGGTTGGTGGGTACCGAGCCAGAGTCTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AACGTACGGAGGGAGATCACAGAAGGGATCGCGAACATGAGGTCCTCGCCGGGGCTCTGCAGCCCGAATCCTAT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TCCATTGCGGGCAGTGAGGGGAGTATATCGGCTTCTGCTGCCTCCGGTCTGGCTGCCCCCTCTGGCCCCAGCTC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TGGCCTCAGCTCTGGCCCCTGTTCCCCAGGCCCCCCAGGGCCCGTCAGTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATT  370

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGTTGGAG  9
                                                                             |||||||||
Sbjct  371  CCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGACAGTGGTCAGGCAGGACCATATGAGAACTGGATGTTGGAG  444

Query   10  CCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAA  83
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAA  518

Query   84  GACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGG  157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGG  592

Query  158  AAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTG  231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTG  666

Query  232  GAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGG  305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGG  740

Query  306  GAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTG  379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTG  814

Query  380  ATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCC  453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCC  888

Query  454  AAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCT  527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCT  962

Query  528  GCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCA  601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCA  1036

Query  602  AGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAG  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAG  1110

Query  676  CGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTT  749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTT  1184

Query  750  GGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCG  823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGGCTGCTGTCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCG  1258

Query  824  TCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGA  897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGA  1332

Query  898  TATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTT  971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTT  1406

Query  972  TGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTC  1045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTC  1480

Query 1046  AGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATT  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATT  1554

Query 1120  GAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAG  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAG  1628

Query 1194  AATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGT  1267
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AATTCAGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGT  1702

Query 1268  CACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCC  1341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCC  1776

Query 1342  CATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGA  1415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGA  1850

Query 1416  TGAGCTG  1422
            |||||||
Sbjct 1851  TGAGCTG  1857