Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13049
- Subject:
- NM_001347933.2
- Aligned Length:
- 1740
- Identities:
- 1330
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGGGGGGGCACAAAGGGGGTCGCTGTGCCTGTCCCCGTGTGATCCGAAAAGTGCTGGCAAAATGCGGCTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGCTTCGCCCGGGGGGGACGTGAATCCTATTCCATTGCGGGCAGTGAGGGGAGTATATCGGCTTCTGCTGCCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCGGTCTGGCTGCCCCCTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGGCCCCTGTTCCCCAGGCCCCCCAGGGCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTCAGTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGACAGTGGTCA 296
Query 1 ----------------------ATGTTGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGC 52
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCAGGACCATATGAGAACTGGATGTTGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGC 370
Query 53 TGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAG 126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAG 444
Query 127 AGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAA 518
Query 201 AATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGA 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGA 592
Query 275 GTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTG 348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTG 666
Query 349 CAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCA 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACAC-------------- 726
Query 423 TATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTG 496
Sbjct 727 -------------------------------------------------------------------------- 726
Query 497 AGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATG 570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 --GAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATG 798
Query 571 AAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCA 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 AAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCA 872
Query 645 AGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 AGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTG 946
Query 719 AGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGG 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 AGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGG 1020
Query 793 CTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGG 866
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CTGCTGTCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGG 1094
Query 867 AGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGG 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 AGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGG 1168
Query 941 AGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTAT 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 AGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTAT 1242
Query 1015 GTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACG 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACG 1316
Query 1089 GGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGC 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 GGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGC 1390
Query 1163 CAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCC 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 CAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCAGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCC 1464
Query 1237 ATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTCACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAA 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 ATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTCACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAA 1538
Query 1311 ACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCT 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 ACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCT 1612
Query 1385 GCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 GCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1650