Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13049
• Subject: NM_182947.4
• Aligned Length: 1740
• Identities: 1420
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGGGGGGGGCACAAAGGGGGTCGCTGTGCCTGTCCCCGTGTGATCCGAAAAGTGCTGGCAAAATGCGGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGCTTCGCCCGGGGGGGACGTGAATCCTATTCCATTGCGGGCAGTGAGGGGAGTATATCGGCTTCTGCTGCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCGGTCTGGCTGCCCCCTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGGCCCCTGTTCCCCAGGCCCCCCAGGGCCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCAGTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGACAGTGGTCA  296

Query    1  ----------------------ATGTTGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGC  52
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCAGGACCATATGAGAACTGGATGTTGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGC  370

Query   53  TGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAG  126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAG  444

Query  127  AGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAA  200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAA  518

Query  201  AATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGA  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGA  592

Query  275  GTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTG  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTG  666

Query  349  CAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCA  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCA  740

Query  423  TATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTG  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTG  814

Query  497  AGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATG  570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATG  888

Query  571  AAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCA  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCA  962

Query  645  AGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTG  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTG  1036

Query  719  AGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGG  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGG  1110

Query  793  CTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGG  866
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCTGTCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGG  1184

Query  867  AGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGG  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGG  1258

Query  941  AGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTAT  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTAT  1332

Query 1015  GTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACG  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACG  1406

Query 1089  GGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGC  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGC  1480

Query 1163  CAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCC  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCAGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCC  1554

Query 1237  ATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTCACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAA  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTCACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATAA  1628

Query 1311  ACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCT  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCCT  1702

Query 1385  GCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG  1740