Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13049
- Subject:
- XM_006513878.2
- Aligned Length:
- 1741
- Identities:
- 1235
- Gaps:
- 323
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGGGGGGTCACAAAGGGGGTCGCTGTGCCTGTCCCCGTGTGATTCGAAAAGTGCTGGCAAAATGCGGCTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGCTTCTCCCGGGGGGGACGTGAATCCTATTCTATTGCCGTCAGTGAGGGGAGCATGTCAGCGTCTGCTGTCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTCTCCGATTCCCCCTGGACCA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGAGAGTGGTCA 296
Query 1 ---------ATGT-------------TGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTTGC 52
|||| ||||||||.||.||.||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 297 GACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAGCCAACTTTAACCACAGGACAAGAGCTGCCCGAACTGACCTTAC 370
Query 53 TGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTGAG 126
||||.|||.||.|||||||.||||||||.|||.|.||||||.||||||||||.||||||||||||||.||..||
Sbjct 371 TGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAAGGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAACTTTGTCCCAAGCTCCCAAG 444
Query 127 AGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAGAA 200
|.||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||.||||||||.|.
Sbjct 445 AATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGGAAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTGAGCTGGTGGAAACAGAAAG 518
Query 201 AATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGAGA 274
||..||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||||
Sbjct 519 AACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTAGAGGGTTACATGGCTACCATGGCTACTCAGGGGGTACCTGAGA 592
Query 275 GTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCTTG 348
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 593 GTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAACATTCAGCAGATCTATGAGTGGCACCGAGACTACTTCCTG 666
Query 349 CAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTGCA 422
||.|||||.||.|.||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 CAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCGATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCAAACATGAGCGCCGACTGCA 740
Query 423 TATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTG 496
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCCAAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTTTG 814
Query 497 AGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCATG 570
|||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 815 AGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACTGCAGCTCAATGACCTCCTCATTAAACCAGTGCAGCGAATCATG 888
Query 571 AAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAGCA 644
|||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||.||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 889 AAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAAAGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGGATACTGAAGAGCTGGAGCA 962
Query 645 AGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATTTG 718
||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||.|.||||||||||
Sbjct 963 AGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAGCGATGCAATGATATGATGTCCCTGGGGAGACTTCGGGGATTTG 1036
Query 719 AGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAGGG 792
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1037 AGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACATTCTTGGTTACAGAGCCTGAAGCTGGGGGT 1110
Query 793 CTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTGGG 866
|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 CTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTGTCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAGGCCCTGGG 1184
Query 867 AGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACTGG 940
||||||||...|||||||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185 AGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGCTACGTGTACAAGAACAGCATCAAGGTGAGCTGCCTAGGGCTGG 1258
Query 941 AGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCTAT 1014
|||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259 AGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTTTGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGAAGGTGGGATCCAGCGCTAC 1332
Query 1015 GTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAACG 1088
||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||.||
Sbjct 1333 GTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTCAAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCCAGATCCTGGAAAGCCAGCG 1406
Query 1089 GGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCGGC 1162
.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407 TGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATTGAATACCAGAGACGTGAGAGCCAGACCAATAGCCTGGGGCGAC 1480
Query 1163 CAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACACCC 1236
||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.|.||||||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1481 CAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAGAATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCAGGCCAGCATGCACACACCC 1554
Query 1237 ATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTC-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGATA 1309
|||||||||||||||||.||.|||||.|| || .||||.||||||||||.||||||..||.|||||.|||||||
Sbjct 1555 ATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-TCTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGAGTGCTGTTGCCCCTGGATA 1627
Query 1310 AACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTCCC 1383
.||||||.||..||||.|.|||||||.||||.||||||| ||||||.|..|||.|||...||.||.||||||
Sbjct 1628 CACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCCTCATGACT---CTCCAGCCCTTCCCACTGTGAACACTCCTCCC 1698
Query 1384 TGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1422
||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 TGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG 1737
