Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13049
• Subject: XM_006513879.3
• Aligned Length: 1669
• Identities: 1235
• Gaps: 251

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGCCGTACCCGGGCAGGAGGGGAATCCTATTCTATTGCCGTCAGTGAGGGGAGCATGTCAGCGTCTGCTGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCGGGGCTGGCTGCCCTGTCTGGCCCCAGCTCTGGCCTCAGCTCTGATCCGTGTTCTCCGATTCCCCCTGGAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAGTAACTGGCCTGAGGAGATGGTTGGATCATTCCAAACATTGTCTCAGTGTGGAAACTGAGGCAGAGAGTGGT  222

Query    1  -----------ATGT-------------TGGAGCCAGCTCTAGCCACAGGAGAGGAGCTGCCGGAACTGACCTT  50
                       ||||             ||||||||.||.||.||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CAGACCGGACAATGTGAGAACTGGACGCTGGAGCCAACTTTAACCACAGGACAAGAGCTGCCCGAACTGACCTT  296

Query   51  GCTGACCACACTGTTGGAGGGCCCTGGAGATAAGACGCAGCCACCTGAAGAGGAGACTTTGTCCCAAGCCCCTG  124
            .|||||.|||.||.|||||||.||||||||.|||.|.||||||.||||||||||.||||||||||||||.||..
Sbjct  297  ACTGACTACATTGCTGGAGGGTCCTGGAGACAAGGCACAGCCAGCTGAAGAGGAAACTTTGTCCCAAGCTCCCA  370

Query  125  AGAGTGAGGAGGAACAGAAGAAGAAGGCTCTGGAAAGGAGTATGTATGTCCTGAGTGAACTGGTAGAAACAGAG  198
            |||.||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  AGAATGAGGAAGAGCAGAAGAAGATGGCTCTGGAAAGGAGTATGTTTGTCCTGGGTGAGCTGGTGGAAACAGAA  444

Query  199  AAAATGTACGTGGACGACTTGGGGCAGATTGTGGAGGGTTATATGGCCACCATGGCTGCTCAGGGGGTCCCCGA  272
            |.||..||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.||
Sbjct  445  AGAACATATGTGGACGACTTGGGACAGATCGTAGAGGGTTACATGGCTACCATGGCTACTCAGGGGGTACCTGA  518

Query  273  GAGTCTTCGAGGCCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAATATCCAGCAAATCTATGAGTGGCACCGAGACTATTTCT  346
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct  519  GAGTCTCCGAGGTCGTGACAGGATTGTGTTTGGGAACATTCAGCAGATCTATGAGTGGCACCGAGACTACTTCC  592

Query  347  TGCAAGAGCTACAACGGTGTCTGAAAGATCCTGATTGGCTGGCTCAGCTATTCATCAAACACGAGCGCCGGCTG  420
            ||||.|||||.||.|.||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  TGCAGGAGCTGCAGCAGTGTTTGAAAGATCCCGATTGGTTGGCTCAGCTGTTCATCAAACATGAGCGCCGACTG  666

Query  421  CATATGTATGTGGTGTACTGTCAGAATAAGCCCAAGTCAGAGCATGTGGTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTT  494
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATATGTATGTGGTGTACTGCCAGAATAAACCCAAGTCAGAGCATGTGCTGTCAGAGTTTGGGGACAGCTACTT  740

Query  495  TGAGGAGCTCCGGCAGCAGCTGGGGCACCGCCTGCAGCTGAACGACCTCCTCATCAAACCTGTGCAGCGGATCA  568
            |||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  741  TGAGGAGCTGAGGCAGCAGCTGGGACACCGACTGCAGCTCAATGACCTCCTCATTAAACCAGTGCAGCGAATCA  814

Query  569  TGAAATACCAGCTGCTGCTCAAGGATTTTCTCAAGTATTACAATAGAGCTGGGATGGATACTGCAGACCTAGAG  642
            |||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct  815  TGAAATACCAGTTGCTGCTGAAGGATTTTCTAAAGTATTACAGAAGAGCTGGGAAGGATACTGAAGAGCTGGAG  888

Query  643  CAAGCTGTGGAGGTCATGTGCTTTGTGCCCAAGCGCTGCAACGATATGATGACGCTGGGGAGATTGCGGGGATT  716
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||.|.||||||||
Sbjct  889  CAAGCTGTGGAGGTCATGTGTTTCGTACCTAAGCGATGCAATGATATGATGTCCCTGGGGAGACTTCGGGGATT  962

Query  717  TGAGGGCAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACTTTCTGGGTCACCGAGCCTGAGGCTGGAG  790
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  963  TGAGGGAAAACTGACTGCTCAGGGGAAGCTCTTGGGCCAGGACACATTCTTGGTTACAGAGCCTGAAGCTGGGG  1036

Query  791  GGCTGCTATCTTCCCGAGGTCGAGAGAGGCGCGTCTTCCTCTTTGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAAGCCCTG  864
            |.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  GTCTGCTTTCTTCCCGGGGTCGGGAGAGGCGTGTCTTCCTGTTCGAGCAAATCATCATCTTCAGTGAGGCCCTG  1110

Query  865  GGAGGAGGAGTGAGAGGTGGAACACAGCCTGGATATGTATACAAGAACAGCATTAAGGTGAGCTGCCTGGGACT  938
            ||||||||||...|||||||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  GGAGGAGGAGGCCGAGGTGGCGCGCAGCCTGGCTACGTGTACAAGAACAGCATCAAGGTGAGCTGCCTAGGGCT  1184

Query  939  GGAGGGGAACCTCCAAGGTGACCCTTGCCGCTTTGCACTGACCTCCAGAGGGCCAGAGGGTGGGATCCAGCGCT  1012
            |||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGGGAATCTCCAAGGCAACCCTTGCCGGTTTGCGCTGACCTCTAGAGGGCCAGAAGGTGGGATCCAGCGCT  1258

Query 1013  ATGTCCTGCAGGCTGCAGACCCTGCTATCAGTCAGGCCTGGATCAAGCATGTGGCTCAGATCTTGGAGAGCCAA  1086
            |.||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||||.
Sbjct 1259  ACGTTCTGCAGGCTTCAGACCCTGCTGTCAGTCAAGCCTGGATAAAGCAAGTGGCCCAGATCCTGGAAAGCCAG  1332

Query 1087  CGGGACTTCCTCAACGCATTGCAGTCACCCATTGAGTACCAGAGACGGGAGAGCCAGACCAACAGCCTGGGGCG  1160
            ||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CGTGACTTTCTCAACGCATTACAGTCACCCATTGAATACCAGAGACGTGAGAGCCAGACCAATAGCCTGGGGCG  1406

Query 1161  GCCAAGAGGGCCTGGAGTGGGGAGCCCTGGAAGAATTCGGCTTGGAGATCAGGCCCAGGGCAGCACACACACAC  1234
            .|||.||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.|.||||||||.|||||..|||||||
Sbjct 1407  ACCAGGAGGGCCTTGGGTAGGGAGCCCTGGGAGAATGCGGCCTGGAGACCTGGCCCAGGCCAGCATGCACACAC  1480

Query 1235  CCATCAATGGCTCTCTCCCCTCTCTGCTGCTGTC-ACCCAAAGGGGAGGTGGCCAGAGCCCTCTTGCCACTGGA  1307
            |||||||||||||||||||.||.|||||.|| || .||||.||||||||||.||||||..||.|||||.|||||
Sbjct 1481  CCATCAATGGCTCTCTCCCTTCCCTGCTACT-TCTGCCCAGAGGGGAGGTGTCCAGAGTGCTGTTGCCCCTGGA  1553

Query 1308  TAAACAGGCCCTTGGTGACATCCCCCAGGCTCCCCATGACTCTCCTCCAGTCTCTCCAACTCCAAAAACCCCTC  1381
            ||.||||||.||..||||.|.|||||||.||||.|||||||   ||||||.|..|||.|||...||.||.||||
Sbjct 1554  TACACAGGCTCTCAGTGATACCCCCCAGACTCCTCATGACT---CTCCAGCCCTTCCCACTGTGAACACTCCTC  1624

Query 1382  CCTGCCAAGCCAGACTTGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG  1422
            ||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  CCTGTCAGGCCAGGCTCGCCAAGCTGGATGAAGATGAGCTG  1665