Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13061
• Subject: XM_011530847.3
• Aligned Length: 1842
• Identities: 1311
• Gaps: 507

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCTGTCTCCGCATCTCCAGTGATCTCTGCAACTTCCAGCGGCGCCGGCGTCCCGGGGGGCTTATTCCGGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGAACCCCTGTACTCGACTCCCAGAGAGCCCCCTCGTCTTACTCCTAATATGATCAATAGTTTCGTGGTTAATA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACCACAGCAACAGTGCCGGAGGCGGCGGCAGGGGCAACACCAACACCAACGAGTGCCGCATGGTCGACATGCAC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGGATGAAGGTGGCTTCGTTCCTGATGGACGGCCAGGAACTGATCTGCCTGCCGCAAGTCTTTGATCTTTTTCT  296

Query    1  ----------ATGCCAGAGTTTCGCTCTGT-TGC-CCAGGCTGCAGTG--------------CAGTGGTGT---  45
                      .||..||..||.|.|.|||| |.| |||.||||.||.|              |.|||||||   
Sbjct  297  CAAGCACCTGGTGGGAGGCTTGCACACTGTGTACACCAAGCTGAAGAGACTGGATATATCCCCCGTGGTGTGTA  370

Query   46  ----------------GATCTT-----GGCT-------------------------CGCTGC-AACTTCCGCCT  72
                            ||||.|     ||||                         |||||| ||||    |.|
Sbjct  371  CTGTTGAGCAGGTCCGGATCCTCCGCGGGCTGGGGGCCATCCAGCCCGGGGTAAACCGCTGCAAACT----CAT  440

Query   73  C-CCAGGTTCAAGGGATTC------TTGTGCCTCAGCCTCCCGAGT-----------AGCTGGAA---------  119
            | |||||   ||.|..|||      ||||   |||     ||||.|           ||..||||         
Sbjct  441  CACCAGG---AAAGACTTCGAAACTTTGT---TCA-----CCGATTGCACCAATGCCAGAAGGAAGAGGCAAAT  503

Query  120  ------------------TTACAGTTCAAGACCCGGCAGGCCCCCTAAGCGTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAA  175
                              |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  GACAAGAAAACAAGCTGTTAACAGTTCAAGACCCGGCAGGCCCCCTAAGCGTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAA  577

Query  176  ATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTATCGCCAGGACTTATCACTCCGACAGGTATAACAGCT  249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  ATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTATCGCCAGGACTTATCACTCCGACAGGTATAACAGCT  651

Query  250  GCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAAGCTTATGGCTATGAACACTCTTCAGGGAAATGGAAG  323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  GCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAAGCTTATGGCTATGAACACTCTTCAGGGAAATGGAAG  725

Query  324  CCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATTCTAACACAGGTGGAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAG  397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATTCTAACACAGGTGGAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAG  799

Query  398  ATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAACATGGAATTGCTCATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCA  471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  ATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAACATGGAATTGCTCATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCA  873

Query  472  GGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCAGAACCACCTGCTAACCAATAGACTGGATCTGCCATT  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  874  GGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCAGAACCACCTGCTAACCAATAGACTGGATCTGCCATT  947

Query  546  TATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTACCTCCTGCATCAGTTGCCATGGCAATGAATCAGATGA  619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  TATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTACCTCCTGCATCAGTTGCCATGGCAATGAATCAGATGA  1021

Query  620  ACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCACAGATTCACAGTCCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCT  693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  ACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCACAGATTCACAGTCCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCT  1095

Query  694  GTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGCTCCTTCTCTAGAAGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCA  767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  GTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGCTCCTTCTCTAGAAGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCA  1169

Query  768  GACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTCCCTCTCAGATGGATCATCATTTGGAAAGAATGGAAG  841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  GACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTCCCTCTCAGATGGATCATCATTTGGAAAGAATGGAAG  1243

Query  842  AGGTACCAGTTCAAATTCCAATAATGAAGTCACCCTTGGACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCC  915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244  AGGTACCAGTTCAAATTCCAATAATGAAGTCACCCTTGGACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCC  1317

Query  916  GCTGGATTCCCTGGACCATTCATTTTTGCTGATAGTCTGTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAG--  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1318  GCTGGATTCCCTGGACCATTCATTTTTGCTGATAGTCTGTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAGGT  1391

Query  988  ----------------------------GGTCTGCTGAAAGTTGCTTTGGATAATGCTCGCATCCAGGAGAAGC  1033
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392  CAACAATATTTCTATAAACAAAATAAATGGTCTGCTGAAAGTTGCTTTGGATAATGCTCGCATCCAGGAGAAGC  1465

Query 1034  AGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGACTGGAGCTCTATAGAGAGAGAGAAATTAGAGAAAACCTTGAAAGA  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466  AGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGACTGGAGCTCTATAGAGAGAGAGAAATTAGAGAAAACCTTGAAAGA  1539

Query 1108  CAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACTACTATGCAAAAGCGCCTGAAGAAGGAGAAAAAAACCAAGAGAAA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540  CAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACTACTATGCAAAAGCGCCTGAAGAAGGAGAAAAAAACCAAGAGAAA  1613

Query 1182  ATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAAGCGCCGGGAGCAAGTGGAGCAGGCACTTAAGCAAGCCACCACTA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614  ATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAAGCGCCGGGAGCAAGTGGAGCAGGCACTTAAGCAAGCCACCACTA  1687

Query 1256  GTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATACTGGAATTCCAGATATTGAAATAGAAAACAATGGGACTCCTCAT  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  GTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATACTGGAATTCCAGATATTGAAATAGAAAACAATGGGACTCCTCAT  1761

Query 1330  GATAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTATTACTGTTTAGAAATGGCACAACAGTTGTATTCAGCC  1395
            |||||||||||||||||||..                                             
Sbjct 1762  GATAGTGCTGCTATGCAAGCC---------------------------------------------  1782