Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13162
- Subject:
- XM_011512419.2
- Aligned Length:
- 2367
- Identities:
- 1957
- Gaps:
- 408
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGAGCCGGGCGGTGGTGAGAGCCAGGCGCTGCCCGCAGTGTCCCCAAGTCCGGGCCGCGGCCGCCGCCCC 74
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGCCTCTGT 10
||||||||||
Sbjct 75 CGCCTGGGCCGCGCTCCCCCTCTCCCGCTCCCTCCCTCCCTGCTCCAACTCCTCCTCCTTCTCCATGCCTCTGT 148
Query 11 TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTGCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATGTGGACAC 84
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTCCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCA------------------- 203
Query 85 ACTGTACTAGGCCCTGAGAGTGGAACCCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTG 158
Sbjct 204 -------------------------------------------------------------------------- 203
Query 159 TGAATGGGAGATCCGTGTAAAGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTG 232
Sbjct 204 -------------------------------------------------------------------------- 203
Query 233 ATTCTTGTCACTTTAATTACTTGAGAATTTATAATGGAATTGGAGTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGT 306
|||||||||||||
Sbjct 204 -------------------------------------------------------------AGGCAAATACTGT 216
Query 307 GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT 290
Query 381 CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA 454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA 364
Query 455 CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA 438
Query 529 TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC 512
Query 603 AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA 586
Query 677 ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG 660
Query 751 GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG 734
Query 825 GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG 808
Query 899 ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC 882
Query 973 ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA 956
Query 1047 CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT 1030
Query 1121 TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG 1104
Query 1195 GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG 1178
Query 1269 CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC 1342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC 1252
Query 1343 AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC 1326
Query 1417 GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC 1400
Query 1491 TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC 1564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC 1474
Query 1565 CTTACTGGGACCGGGCAGGTTTTTATTTAATGGTCTCTTTGGCTTGCCGTCACAATGAAGGTTGGTGGAAAGGA 1638
|||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1475 CTTACTGGGACCGGGC------------------------------------------AGGTTGGTGGAAAGGA 1506
Query 1639 ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGTGAAGTTAA 1712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1507 ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGCGAAGTTAA 1580
Query 1713 TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG 1786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG 1654
Query 1787 GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA 1728
Query 1861 GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA 1934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA 1802
Query 1935 TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA 2008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA 1876
Query 2009 AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC 2082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC 1950
Query 2083 TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA 2024
Query 2157 GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT 2229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT 2097