Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13274
• Subject: NM_001097644.1
• Aligned Length: 873
• Identities: 673
• Gaps: 159

Alignment

Query   1  ATGCCCGAAGATTTAGCTTTGGAGTCAAACCCTTCTGACCATCCAAGGGCAAGCACAATTTTCCTGAGCAAATC  74
           ||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCCCGAAGATCTAGCTTTGGAATCAAACCCTTCCGACCACCCGAGGGCAAGCACAATTTTCCTGAGCAAATC  74

Query  75  TCAAACGGATGTGCGAGAAAAGAGGAAGAGCAACCATTTGAACCAT----------------------------  120
           |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||                            
Sbjct  75  TCAAACGGATGTGCGTGAAAAGAGGAAGAGCAACCATTTAAACCATGTATCTCCAGGGCAGCTTACTAAAAAGT  148

Query 121  -------------------------------------------------------------------------T  121
                                                                                    |
Sbjct 149  ATAGCTCATGCTCAACAATATTTCTAGATGACAGCACAGTCAGCCAGCCTAACCTTAGAACCACAATAAAATGT  222

Query 122  GTGACCTTAGCAATATATTACCACATAAAGAACAG---------------------------------------  156
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 223  GTGACCTTAGCAATATATTACCACATAAAGAACAGAGATGCAAATAGATCCCTGGACATTTTTGATGAGCGGTC  296

Query 157  -------------CGAGAAAAAGTTCCAGAGGAATACTTTAAGCATGATCCTGAGCACAAATTTATTTACAGAT  217
                        .||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACATCCTCTCACAAGAGAGAAAGTTCCAGAGGAGTACTTTAAGCATGACCCTGAACACAAATTTATTTACAGAT  370

Query 218  TTGTTCGTACTCTTTTTAGTGCTGCACAGCTAACAGCTGAATGTGCAATAGTAACTTTGGTTTACTTAGAAAGG  291
           ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 371  TTGTTCGTACACTTTTTAGTGCTGCACAGCTGACAGCGGAATGTGCAATAGTGACGTTGGTTTACTTAGAGAGG  444

Query 292  CTTTTAACTTATGCTGAAATCGACATTTGTCCCACCAACTGGAAAAGGATTGTTCTGGGAGCCATTCTTCTTGC  365
           ||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CTCCTAACTTATGCTGAGATCGACATTTGTCCCACCAACTGGAAAAGAATTGTTCTGGGAGCCATTCTTCTTGC  518

Query 366  CTCCAAGGTTTGGGACGATCAGGCTGTATGGAATGTGGACTACTGCCAGATCCTCAAGGACATTACAGTTGAGG  439
           |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519  CTCCAAGGTTTGGGATGACCAGGCTGTATGGAATGTAGACTACTGCCAGATCCTCAAGGACATTACGGTTGAGG  592

Query 440  ACATGAATGAAATGGAAAGGCATTTTCTGGAGCTTCTTCAGTTTAATATTAATGTTCCTGCCAGTGTTTATGCC  513
           ||||||||||.||||||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ACATGAATGAGATGGAAAGGCATTTCTTGGAGCTACTCCAGTTTAATATTAATGTTCCTGCCAGTGTTTATGCC  666

Query 514  AAATACTACTTTGACCTTCGCTCCTTAGCAGATGACAACAACCTGAATTTTCTATTTGCTCCTCTTAGCAAAGA  587
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 667  AAATACTACTTTGACCTTCGCTCCTTAGCAGATGACAACAACCTGAATTTTCTGTTTGCTCCTCTCAGCAAAGA  740

Query 588  AAGAGCACAGAACCTAGAGGCTATTTCTAGATTGTGTGAAG------ACAAAGACTTGTGTAGAGCCGCTATGA  655
           |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||      |||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741  AAGAGCACAGAACCTAGAGGCCATTTCAAGATTGTGTGAAGACAAATACAAAGACTTGTGTAGAGCTGCTATGA  814

Query 656  GAAGGTCTTTCAGTGCTGATAACTTCATTGGTATTCAGCGCTCTAAAGCCATCCTCTCT  714
           ||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815  GAAGATCTTTAAGCGCTGATAATTTCATTGGTATTCAGCGCTCTAATGCCATCCTCTCT  873