Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13291
• Subject: NM_001114124.2
• Aligned Length: 1189
• Identities: 1010
• Gaps: 153

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSAGGNARKSTGRPSYYYRLLRRPRLQRQRSRSRSRTRPARESPQERPGSRRSLPGSMSEKNPSMEPSASTPFR  74

Query    1  --------------------------------------------------MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALD  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  VTGFLSRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSFRHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKESRSHESLLSPSSAVEALD  148

Query   25  LSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEA  98
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LSMEEEVIIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEA  222

Query   99  KDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSL  172
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  KDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTSKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSL  296

Query  173  PAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAK  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTVSILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAK  370

Query  247  TKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKA  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKA  444

Query  321  LYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLIS  394
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  LYESDENCEVDPSKCSSADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLIS  518

Query  395  ASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFL  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFL  592

Query  469  LEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTND  542
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLDQSVVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTND  666

Query  543  LASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMA  616
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LASTPGSGSSSVSAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMA  740

Query  617  NGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSE  690
            ||.|||||||||||||||||||||.|||.||.|||..|.||.|||||||.||.||||||||||..|||||||||
Sbjct  741  NGSKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPVGPDALPADGQVPATQLLAGWPARAAPVSLAGLATVRRAVPTPTTPGTSE  814

Query  691  GAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGE  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGE  888

Query  765  LARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVG  838
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  889  LARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPTLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWAG  962

Query  839  PSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELS  912
            |.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  PGTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAMHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKEELS  1036

Query  913  QAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVE  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  QAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVE  1110

Query  987  EELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKE--SMH----------------------  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.                      
Sbjct 1111  EELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKERYSMQARNGVSPTNPTKLQITENGEFR  1184

Query 1037  -----  1036
                 
Sbjct 1185  NSSNC  1189