Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13291
• Subject: NM_001114125.1
• Aligned Length: 1132
• Identities: 1011
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MEPDSLLDPGDSYESPQERPGSRRSLPGSMSEKNPSMEPSASTPFRVTGFLSRRLKGSIKRTKSQPKLDRNHSF  74

Query    1  ----------------------MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTS  52
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct   75  RHILPGFRSAAAAAADNERSHLMPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVIIKPVHSSILGQDYCFEVTTS  148

Query   53  SGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLK  126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  SGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTSKLK  222

Query  127  TDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGP  200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGP  296

Query  201  GPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMM  274
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GPMIRIKARYQTVSILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMM  370

Query  275  SEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLK  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  371  SEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSADLPEHQGNLK  444

Query  349  MCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDR  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  MCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDR  518

Query  423  TARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSL  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSL  592

Query  497  HSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGL  570
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  593  HSLLWEAVSQLDQSVVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSVSAGLQKMVIENDLSGL  666

Query  571  IDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPD  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  667  IDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGSKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPVGPD  740

Query  645  VLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLS  718
            .||.|||..|.||.|||||||.||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ALPADGQVPATQLLAGWPARAAPVSLAGLATVRRAVPTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLS  814

Query  719  PRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRR  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  PRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRR  888

Query  793  IDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQG  866
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  889  IDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPTLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWAGPGTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAMHKQG  962

Query  867  PSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFK  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  PSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKEELSQAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFK  1036

Query  941  CQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRI  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRI  1110

Query 1015  ASLDAANARLMSALTQLKESMH  1036
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ASLDAANARLMSALTQLKESMH  1132