Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13291
• Subject: NM_001290640.1
• Aligned Length: 1112
• Identities: 1010
• Gaps: 76

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSM  27
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGLCGLGLLGDNLGKILCWSGGATLWRPSHPRKPHLAAGPQMPRSHLMPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSM  74

Query   28  EEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDL  101
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  EEEVIIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLRRAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDL  148

Query  102  PAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAA  175
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  PAKKKYLCELCLDDVLYARTTSKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVTVHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAA  222

Query  176  SVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKE  249
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  SVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTVSILPMEMYKEFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKE  296

Query  250  EMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYE  323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  EMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATKAIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYE  370

Query  324  SDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASL  397
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  SDENCEVDPSKCSSADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELKEVFASWRQECSSRGRPDISERLISASL  444

Query  398  FLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEI  471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFGSKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEI  518

Query  472  SNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLAS  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLDQSVVSKLGPLPRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLAS  592

Query  546  TPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGG  619
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  TPGSGSSSVSAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRSSGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGS  666

Query  620  KSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARATPVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAP  693
            |||||||||||||||||||||.|||.||.|||..|.||.|||||||.||.||||||||||..||||||||||||
Sbjct  667  KSLSMVDLQDARTLDGEAGSPVGPDALPADGQVPATQLLAGWPARAAPVSLAGLATVRRAVPTPTTPGTSEGAP  740

Query  694  GRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELAR  767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSEELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELAR  814

Query  768  RQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPNLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPST  841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  815  RQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPTLLSTLQYPRPSSGTLASASPDWAGPGT  888

Query  842  RLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAE  915
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  889  RLRQQSSSSKGDSPELKPRAMHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQLLEDEGLGPDPPHRDRLRSKEELSQAE  962

Query  916  KDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEEL  989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  KDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEERLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEEL  1036

Query  990  KKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKE--SMH-------------------------  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.                         
Sbjct 1037  KKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKERYSMQARNGVSPTNPTKLQITENGEFRNSS  1110

Query 1037  --  1036
              
Sbjct 1111  NC  1112