Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13291
• Subject: NM_001290641.1
• Aligned Length: 1065
• Identities: 1010
• Gaps: 29

Alignment

Query    1  MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVVIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLR  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPRLKESRSHESLLSPSSAVEALDLSMEEEVIIKPVHSSILGQDYCFEVTTSSGSKCFSCRSAAERDKWMENLR  74

Query   75  RAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTGKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  RAVHPNKDNSRRVEHILKLWVIEAKDLPAKKKYLCELCLDDVLYARTTSKLKTDNVFWGEHFEFHNLPPLRTVT  148

Query  149  VHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTITILPMEMYK  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  149  VHLYRETDKKKKKERNSYLGLVSLPAASVAGRQFVEKWYPVVTPNPKGGKGPGPMIRIKARYQTVSILPMEMYK  222

Query  223  EFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATK  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  EFAEHITNHYLGLCAALEPILSAKTKEEMASALVHILQSTGKVKDFLTDLMMSEVDRCGDNEHLIFRENTLATK  296

Query  297  AIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSAADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELK  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AIEEYLKLVGQKYLQDALGEFIKALYESDENCEVDPSKCSSADLPEHQGNLKMCCELAFCKIINSYCVFPRELK  370

Query  371  EVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  EVFASWRQECSSRGRPDISERLISASLFLRFLCPAIMSPSLFNLLQEYPDDRTARTLTLIAKVTQNLANFAKFG  444

Query  445  SKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLEQSIVSKLGPL  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  445  SKEEYMSFMNQFLEHEWTNMQRFLLEISNPETLSNTAGFEGYIDLGRELSSLHSLLWEAVSQLDQSVVSKLGPL  518

Query  519  PRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSISAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRS  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  PRILRDVHTALSTPGSGQLPGTNDLASTPGSGSSSVSAGLQKMVIENDLSGLIDFTRLPSPTPENKDLFFVTRS  592

Query  593  SGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGGKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPAGPDVLPTDGQAAAAQLVAGWPARAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||.|||..|.||.|||||||.
Sbjct  593  SGVQPSPARSSSYSEANEPDLQMANGSKSLSMVDLQDARTLDGEAGSPVGPDALPADGQVPATQLLAGWPARAA  666

Query  667  PVNLAGLATVRRAGQTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSE  740
            ||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  PVSLAGLATVRRAVPTPTTPGTSEGAPGRPQLLAPLSFQNPVYQMAAGLPLSPRGLGDSGSEGHSSLSSHSNSE  740

Query  741  ELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPN  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  741  ELAAAAKLGSFSTAAEELARRPGELARRQMSLTEKGGQPTVPRQNSAGPQRRIDQPPPPPPPPPPAPRGRTPPT  814

Query  815  LLSTLQYPRPSSGTLASASPDWVGPSTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAVHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQ  888
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  LLSTLQYPRPSSGTLASASPDWAGPGTRLRQQSSSSKGDSPELKPRAMHKQGPSPVSPNALDRTAAWLLTMNAQ  888

Query  889  LLEDEGLGPDPPHRDRLRSKDELSQAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEE  962
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LLEDEGLGPDPPHRDRLRSKEELSQAEKDLAVLQDKLRISTKKLEEYETLFKCQEETTQKLVLEYQARLEEGEE  962

Query  963  RLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKE--S  1034
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
Sbjct  963  RLRRQQEDKDIQMKGIISRLMSVEEELKKDHAEMQAAVDSKQKIIDAQEKRIASLDAANARLMSALTQLKERYS  1036

Query 1035  MH---------------------------  1036
            |.                           
Sbjct 1037  MQARNGVSPTNPTKLQITENGEFRNSSNC  1065