Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13291
- Subject:
- XM_006498304.3
- Aligned Length:
- 3547
- Identities:
- 2793
- Gaps:
- 440
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCGCTGGGCGCTCGGCCGGCCGAGCGCTCGCCTGGGCCTCCCTGCCGCTGCTGGGGCCTCCCGCGGGCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACTCTGCGGGGACACGCTCTGCAGCAGAGAGTCGCCCCAAGAAAGGCCGGGCTCCCGGCGGAGCCTTCCCGGCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GCATGTCAGAGAAAAACCCCAGCATGGAGCCCTCGGCTTCAACCCCGTTCCGGGTCACGGGCTTCCTCAGCCGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAACTGGACCGCAACCACAGCTTCCGCCACATCCT 296
Query 1 -------------------------------------------------------ATGCCGAGGCTGAAGGAGT 19
|||||.|||||||||||||
Sbjct 297 GCCGGGGTTCCGGAGCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCAAGGCTGAAGGAGT 370
Query 20 CTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTG 93
||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 CTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCTCAGCATGGAGGAGGAGGTG 444
Query 94 GTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAA 167
.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 ATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACAACATCATCAGGAAGCAA 518
Query 168 GTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACA 241
|||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||||
Sbjct 519 GTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGGCGAGCAGTGCACCCCAACA 592
Query 242 AGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAG 315
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 593 AGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAAGGATCTGCCGGCCAAGAAG 666
Query 316 AAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGT 389
|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCAAGCTCAAGACGGACAATGT 740
Query 390 TTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGA 463
.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 CTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACTGTGCACCTGTATCGGGAGA 814
Query 464 CCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGG 537
|.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 815 CTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCCTGCCGCCTCTGTGGCTGGG 888
Query 538 CGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGAT 611
||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 889 CGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCAAAGGCCCTGGGCCCATGAT 962
Query 612 CCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCA 685
|||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 963 CCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAGGAGTTTGCGGAGCACATCA 1036
Query 686 CCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCT 759
|.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037 CTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCGTCG 1110
Query 760 GCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGA 833
||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGA 1184
Query 834 CCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCA 907
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 CCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATCGAGGAATACCTCA 1258
Query 908 AGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAAC 981
|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259 AACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCTGTATGAGTCAGATGAAAAT 1332
Query 982 TGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGA 1055
||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1333 TGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGTGA 1406
Query 1056 GCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGA 1129
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1407 GCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAGGAGGTGTTCGCCTCATGGC 1480
Query 1130 GGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTC 1203
||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 GGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTTCGCTTC 1554
Query 1204 CTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCAC 1277
||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1555 CTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTGACGACCGCACGGCTCGCAC 1628
Query 1278 CCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGT 1351
||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629 CCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGCAGCAAGGAAGAATACATGT 1702
Query 1352 CCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAG 1425
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTTGGAGATCTCCAACCCCGAG 1776
Query 1426 ACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCT 1499
|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777 ACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCTCTAGCCTGCACTCCCTGCT 1850
Query 1500 CTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACG 1573
||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1851 CTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTGCCTCGTATCCTGAGGGATG 1924
Query 1574 TCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCT 1647
|||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925 TCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCTGGCCTCCACCCCGGGCTCC 1998
Query 1648 GGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCAC 1721
||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCTCTGGTCTGATAGATTTCAC 2072
Query 1722 CCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCAC 1795
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073 CCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCTTCAC 2146
Query 1796 CTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCC 1869
|||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||..||||||||||.|||
Sbjct 2147 CTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAATGGCAGCAAGAGCCTGTCC 2220
Query 1870 ATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCAC 1943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.||||.|||.||..|
Sbjct 2221 ATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGGGCCCAGACGCCCTACCTGC 2294
Query 1944 AGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGC 2017
.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||.|||||||||..
Sbjct 2295 TGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCCCCAGTGAGCCTGGCAGGAT 2368
Query 2018 TGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCA 2090
|||||||.||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2369 TGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGTGCACCAGGACGGCCCCA 2441
Query 2091 GCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCC 2164
|.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2442 GTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTGCCACTGTCACCCCGTGGCC 2515
Query 2165 TTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCC 2238
||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.||||.||.||||||
Sbjct 2516 TTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGAAGAGCTGGCAGCCGCTGCC 2589
Query 2239 AAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTC 2312
||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||.|.||||||||
Sbjct 2590 AAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAACTGGCACGGAGGCAGATGTC 2663
Query 2313 ACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGC 2386
|||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 2664 ACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCCCAGCGGAGGATTGACCAGC 2737
Query 2387 CTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAG 2460
|.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.|||||||||||||||.|||
Sbjct 2738 CGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTACCCTGCTGAGCACCCTACAG 2811
Query 2461 TACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCA 2534
||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..|||||..|.|||||.|||.||||
Sbjct 2812 TACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCCCTGGCACCCGGCTGCGGCA 2885
Query 2535 GCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTG 2608
.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2886 ACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCACAAGCAGGGCCCTTCACCCG 2959
Query 2609 TGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGC 2682
|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2960 TCAGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGT 3033
Query 2683 CTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGC 2756
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3034 CTGGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAGCCAAGCAGAAAAGGATCTGGC 3107
Query 2757 GGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGG 2830
.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 3108 AGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTATTCAAGTGCCAGGAGG 3181
Query 2831 AGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAG 2904
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 AGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAG 3255
Query 2905 GAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCA 2978
||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 3256 GAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAGAAGAACTGAAGAAGGATCA 3329
Query 2979 CGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGG 3052
.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 3330 TGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAAAAGCGCATTGCCTCGCTGG 3403
Query 3053 ATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT---------------- 3108
||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .||||
Sbjct 3404 ATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAGCCCGTAACGGC 3477
Query 3109 --------------------------------------------------------------------- 3108
Sbjct 3478 GTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGCAATTGT 3546