Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13291
- Subject:
- XM_006498305.3
- Aligned Length:
- 3484
- Identities:
- 2793
- Gaps:
- 377
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGCCCGACTCCCTCCTGGACCCAGGCGACTCCTACGAGTCGCCCCAAGAAAGGCCGGGCTCCCGGCGGAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCTTCCCGGCAGCATGTCAGAGAAAAACCCCAGCATGGAGCCCTCGGCTTCAACCCCGTTCCGGGTCACGGGCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCCTCAGCCGCCGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAACTGGACCGCAACCACAGCTTC 222
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGCCGAG 8
|||||.||
Sbjct 223 CGCCACATCCTGCCGGGGTTCCGGAGCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCAAG 296
Query 9 GCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGG 82
|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGAAGGAGTCTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCTCAGCATGG 370
Query 83 AGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCA 156
||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 371 AGGAGGAGGTGATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACAACATCA 444
Query 157 TCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGT 230
||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||
Sbjct 445 TCAGGAAGCAAGTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGGCGAGCAGT 518
Query 231 GCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGC 304
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 519 GCACCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAAGGATCTGC 592
Query 305 CAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAG 378
|.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||
Sbjct 593 CGGCCAAGAAGAAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCAAGCTCAAG 666
Query 379 ACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCT 452
|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 667 ACGGACAATGTCTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACTGTGCACCT 740
Query 453 GTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCT 526
|||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 741 GTATCGGGAGACTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCCTGCCGCCT 814
Query 527 CGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCT 600
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 815 CTGTGGCTGGGCGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCAAAGGCCCT 888
Query 601 GGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGC 674
||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 889 GGGCCCATGATCCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAGGAGTTTGC 962
Query 675 TGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGG 748
.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGCACATCACTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGG 1036
Query 749 AGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATG 822
|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATGGCGTCGGCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACCTGATGATG 1110
Query 823 TCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGA 896
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 TCAGAGGTGGACCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATCGA 1184
Query 897 GGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGT 970
|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 GGAATACCTCAAACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCTGTATGAGT 1258
Query 971 CAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAG 1044
|||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGATGAAAATTGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCAACCTCAAG 1332
Query 1045 ATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTT 1118
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1333 ATGTGCTGTGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAGGAGGTGTT 1406
Query 1119 TGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCT 1192
.|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGCCTCATGGCGGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGCCTCCCTCT 1480
Query 1193 TCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGC 1266
||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1481 TCCTTCGCTTCCTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTGACGACCGC 1554
Query 1267 ACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGA 1340
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555 ACGGCTCGCACCCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGCAGCAAGGA 1628
Query 1341 GGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCT 1414
.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1629 AGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTTGGAGATCT 1702
Query 1415 CCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTG 1488
||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1703 CCAACCCCGAGACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCTCTAGCCTG 1776
Query 1489 CACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGAT 1562
|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777 CACTCCCTGCTCTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTGCCTCGTAT 1850
Query 1563 CCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCA 1636
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCTGAGGGATGTCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCTGGCCTCCA 1924
Query 1637 CACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTG 1710
|.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 1925 CCCCGGGCTCCGGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCTCTGGTCTG 1998
Query 1711 ATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGT 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGT 2072
Query 1785 CCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCA 1858
||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||..|||
Sbjct 2073 CCAGCCTTCACCTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAATGGCAGCA 2146
Query 1859 AGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGAC 1932
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||
Sbjct 2147 AGAGCCTGTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGGGCCCAGAC 2220
Query 1933 GTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAA 2006
|.|||.||..|.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||.
Sbjct 2221 GCCCTACCTGCTGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCCCCAGTGAG 2294
Query 2007 CCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCA 2079
|||||||||..|||||||.||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2295 CCTGGCAGGATTGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGTGCACCA 2367
Query 2080 GGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTC 2153
||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2368 GGACGGCCCCAGTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTGCCACTGTC 2441
Query 2154 ACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGG 2227
|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||
Sbjct 2442 ACCCCGTGGCCTTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGAAGAGCTGG 2515
Query 2228 CGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGG 2301
|.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 2516 CAGCCGCTGCCAAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAACTGGCACGG 2589
Query 2302 CGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAG 2375
.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.||||||.||||
Sbjct 2590 AGGCAGATGTCACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCCCAGCGGAG 2663
Query 2376 GATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGA 2449
|||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.||||||||
Sbjct 2664 GATTGACCAGCCGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTACCCTGCTGA 2737
Query 2450 GCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACC 2523
|||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..|||||..|.|||
Sbjct 2738 GCACCCTACAGTACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCCCTGGCACC 2811
Query 2524 CGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGG 2597
||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||||||||||||
Sbjct 2812 CGGCTGCGGCAACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCACAAGCAGGG 2885
Query 2598 CCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAG 2671
|||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 CCCTTCACCCGTCAGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAG 2959
Query 2672 AAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAA 2745
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2960 AAGACGAGGGTCTGGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAGCCAAGCAGAA 3033
Query 2746 AAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAA 2819
|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3034 AAGGATCTGGCAGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTATTCAA 3107
Query 2820 GTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGC 2893
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 3108 GTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGAGCGGCTGC 3181
Query 2894 GGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTG 2967
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 3182 GGCGGCAGCAGGAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAGAAGAACTG 3255
Query 2968 AAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCAT 3041
||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 3256 AAGAAGGATCATGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAAAAGCGCAT 3329
Query 3042 TGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT----- 3108
|||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .||||
Sbjct 3330 TGCCTCGCTGGATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAG 3403
Query 3109 -------------------------------------------------------------------------- 3108
Sbjct 3404 CCCGTAACGGCGTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGC 3477
Query 3109 ------ 3108
Sbjct 3478 AATTGT 3483