Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13291
Subject:
XM_006498311.1
Aligned Length:
3397
Identities:
2793
Gaps:
290

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCAGAGAAAAACCCCAGCATGGAGCCCTCGGCTTCAACCCCGTTCCGGGTCACGGGCTTCCTCAGCCGCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAACTGGACCGCAACCACAGCTTCCGCCACATCCTGC  148

Query    1  -----------------------------------------------------ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCT  21
                                                                 |||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CGGGGTTCCGGAGCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCAAGGCTGAAGGAGTCT  222

Query   22  CGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGT  95
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  223  CGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCTCAGCATGGAGGAGGAGGTGAT  296

Query   96  CATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGT  169
            .|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACAACATCATCAGGAAGCAAGT  370

Query  170  GCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAG  243
            |.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  GTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGGCGAGCAGTGCACCCCAACAAG  444

Query  244  GACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAA  317
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  GACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAAGGATCTGCCGGCCAAGAAGAA  518

Query  318  GTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTT  391
            |||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCAAGCTCAAGACGGACAATGTCT  592

Query  392  TCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACC  465
            |||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  593  TCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACTGTGCACCTGTATCGGGAGACT  666

Query  466  GACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCG  539
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  GACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCCTGCCGCCTCTGTGGCTGGGCG  740

Query  540  GCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCC  613
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCAAAGGCCCTGGGCCCATGATCC  814

Query  614  GCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACC  687
            |.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct  815  GAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAGGAGTTTGCGGAGCACATCACT  888

Query  688  AACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGC  761
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  AACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCGTCGGC  962

Query  762  CCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACC  835
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACC  1036

Query  836  GCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAG  909
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1037  GCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATCGAGGAATACCTCAAA  1110

Query  910  CTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTG  983
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  CTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCTGTATGAGTCAGATGAAAATTG  1184

Query  984  CGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGC  1057
            .||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  TGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGTGAGC  1258

Query 1058  TGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGG  1131
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||.||
Sbjct 1259  TGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAGGAGGTGTTCGCCTCATGGCGG  1332

Query 1132  CAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCT  1205
            ||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  CAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTTCGCTTCCT  1406

Query 1206  CTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCC  1279
            .|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1407  GTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTGACGACCGCACGGCTCGCACCC  1480

Query 1280  TCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCC  1353
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  TCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGCAGCAAGGAAGAATACATGTCC  1554

Query 1354  TTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGAC  1427
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTTGGAGATCTCCAACCCCGAGAC  1628

Query 1428  CCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCT  1501
            |||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1629  CCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCTCTAGCCTGCACTCCCTGCTCT  1702

Query 1502  GGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTC  1575
            ||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1703  GGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTGCCTCGTATCCTGAGGGATGTC  1776

Query 1576  CACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGG  1649
            |||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777  CACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCTGGCCTCCACCCCGGGCTCCGG  1850

Query 1650  CAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCC  1723
            ||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCTCTGGTCTGATAGATTTCACCC  1924

Query 1724  GGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCT  1797
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1925  GGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCTTCACCT  1998

Query 1798  GCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCAT  1871
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||..||||||||||.|||||
Sbjct 1999  GCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAATGGCAGCAAGAGCCTGTCCAT  2072

Query 1872  GGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAG  1945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.||||.|||.||..|.|
Sbjct 2073  GGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGGGCCCAGACGCCCTACCTGCTG  2146

Query 1946  ATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTG  2019
            |.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.|||||||||.|||||||||..||
Sbjct 2147  ACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCCCCAGTGAGCCTGGCAGGATTG  2220

Query 2020  GCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGC  2092
            |||||.||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.
Sbjct 2221  GCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGTGCACCAGGACGGCCCCAGT  2293

Query 2093  TGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTT  2166
            |||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2294  TGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTGCCACTGTCACCCCGTGGCCTT  2367

Query 2167  GGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAA  2240
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct 2368  GGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGAAGAGCTGGCAGCCGCTGCCAA  2441

Query 2241  GCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCAC  2314
            .||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||.|.||||||||||
Sbjct 2442  ACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAACTGGCACGGAGGCAGATGTCAC  2515

Query 2315  TGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCT  2388
            |||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.||||||.|||||||.||||||||.
Sbjct 2516  TGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCCCAGCGGAGGATTGACCAGCCG  2589

Query 2389  CCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTA  2462
            ||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 2590  CCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTACCCTGCTGAGCACCCTACAGTA  2663

Query 2463  CCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGC  2536
            ||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..|||||..|.|||||.|||.||||.|
Sbjct 2664  CCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCCCTGGCACCCGGCTGCGGCAAC  2737

Query 2537  AGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTG  2610
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2738  AGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCACAAGCAGGGCCCTTCACCCGTC  2811

Query 2611  AGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCT  2684
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2812  AGTCCCAATGCCCTGGACCGCACGGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGTCT  2885

Query 2685  GGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGG  2758
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2886  GGGCCCAGATCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGAGGAACTCAGCCAAGCAGAAAAGGATCTGGCAG  2959

Query 2759  TGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAG  2832
            ||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2960  TGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTATTCAAGTGCCAGGAGGAG  3033

Query 2833  ACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGA  2906
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034  ACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGA  3107

Query 2907  GGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACG  2980
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 3108  AGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAGAAGAACTGAAGAAGGATCATG  3181

Query 2981  CAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGAT  3054
            |||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 3182  CAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAAAAGCGCATTGCCTCGCTGGAT  3255

Query 3055  GCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT------------------  3108
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .||||                  
Sbjct 3256  GCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAGCCCGTAACGGCGT  3329

Query 3109  -------------------------------------------------------------------  3108
                                                                               
Sbjct 3330  CTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGCAATTGT  3396