Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13291
• Subject: XM_011239173.2
• Aligned Length: 3196
• Identities: 2648
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCT  74
            |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCAAGGCTGAAGGAGTCTCGGTCACACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGCGCAGTGGAGGCCCTGGACCT  74

Query   75  CAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGA  148
            ||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCATGGAGGAGGAGGTGATTATCAAGCCCGTTCACAGCAGCATCCTGGGTCAGGACTACTGCTTCGAGGTGA  148

Query  149  CGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGG  222
            |.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||
Sbjct  149  CAACATCATCAGGAAGCAAGTGTTTTTCCTGCCGGTCAGCCGCTGAGCGCGATAAGTGGATGGAGAACCTGAGG  222

Query  223  CGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAA  296
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  CGAGCAGTGCACCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCATATCCTGAAGCTGTGGGTGATTGAGGCCAA  296

Query  297  GGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCA  370
            |||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct  297  GGATCTGCCGGCCAAGAAGAAGTATCTATGTGAACTGTGCCTGGACGATGTGCTGTATGCCCGTACCACAAGCA  370

Query  371  AGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACT  444
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  AGCTCAAGACGGACAATGTCTTCTGGGGAGAGCACTTTGAGTTCCATAACCTGCCGCCTCTACGCACAGTCACT  444

Query  445  GTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACC  518
            ||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GTGCACCTGTATCGGGAGACTGACAAGAAAAAGAAAAAGGAACGCAACAGCTACCTGGGCCTGGTGAGCCTGCC  518

Query  519  TGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCA  592
            |||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  TGCCGCCTCTGTGGCTGGGCGGCAGTTTGTGGAGAAGTGGTACCCAGTGGTGACACCCAACCCCAAGGGTGGCA  592

Query  593  AGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAA  666
            |.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||.||||.||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  AAGGCCCTGGGCCCATGATCCGAATCAAGGCACGCTACCAGACCGTCAGCATCTTGCCTATGGAGATGTACAAG  666

Query  667  GAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGAC  740
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGTTTGCGGAGCACATCACTAACCACTACCTGGGGCTGTGCGCAGCCCTGGAACCCATCCTCAGTGCCAAGAC  740

Query  741  CAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACC  814
            |||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  CAAGGAGGAGATGGCGTCGGCTCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGAAAGGTGAAGGACTTTCTAACAGACC  814

Query  815  TGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAG  888
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGTGGGGACAATGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAG  888

Query  889  GCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCT  962
            |||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  GCCATCGAGGAATACCTCAAACTTGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCACTAGGTGAGTTCATCAAAGCTCT  962

Query  963  GTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCA  1036
            |||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GTATGAGTCAGATGAAAATTGTGAAGTGGACCCAAGCAAGTGCTCATCCGCTGACCTCCCTGAGCACCAGGGCA  1036

Query 1037  ACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAA  1110
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||.
Sbjct 1037  ACCTCAAGATGTGCTGTGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGCGTCTTCCCACGGGAGCTTAAG  1110

Query 1111  GAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGC  1184
            ||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGTGTTCGCCTCATGGCGGCAGGAGTGTAGCAGCCGAGGCCGGCCAGATATCAGTGAACGGCTCATCAGCGC  1184

Query 1185  CTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTG  1258
            ||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  CTCCCTCTTCCTTCGCTTCCTGTGCCCTGCCATCATGTCACCCTCGCTCTTCAACCTGCTTCAGGAGTATCCTG  1258

Query 1259  ATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGC  1332
            |.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  ACGACCGCACGGCTCGCACCCTCACGCTCATTGCCAAAGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAGTTTGGC  1332

Query 1333  AGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCT  1406
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1333  AGCAAGGAAGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTGGAGCACGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGTT  1406

Query 1407  GGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  GGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTTTCCAACACAGCAGGCTTCGAGGGCTACATAGACCTGGGCCGGGAGCTCT  1480

Query 1481  CCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTG  1554
            |.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1481  CTAGCCTGCACTCCCTGCTCTGGGAAGCTGTCAGCCAGCTTGATCAGAGCGTTGTGTCGAAGCTGGGACCTCTG  1554

Query 1555  CCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCT  1628
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555  CCTCGTATCCTGAGGGATGTCCACACAGCACTGAGCACTCCTGGCAGTGGGCAGCTCCCTGGCACCAATGACCT  1628

Query 1629  GGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTT  1702
            |||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1629  GGCCTCCACCCCGGGCTCCGGCAGCAGCAGCGTCTCTGCTGGGCTTCAGAAGATGGTGATTGAAAATGACCTCT  1702

Query 1703  CCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCC  1776
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCC  1776

Query 1777  TCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAA  1850
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1777  TCCGGGGTCCAGCCTTCACCTGCCCGCAGCTCAAGCTACTCAGAAGCCAATGAACCTGACCTGCAGATGGCCAA  1850

Query 1851  CGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGG  1924
            .||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||
Sbjct 1851  TGGCAGCAAGAGCCTGTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGTTCCCCAGTGG  1924

Query 1925  GCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACC  1998
            ||||.||||.|||.||..|.||.|||||||...||||..||||||||.||||.||||||||.|||.|||||.||
Sbjct 1925  GCCCAGACGCCCTACCTGCTGACGGGCAGGTGCCTGCGACTCAGCTGCTGGCTGGGTGGCCAGCCAGGGCAGCC  1998

Query 1999  CCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAG-GCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGG  2071
            |||||||.|||||||||..|||||||.||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCAGTGAGCCTGGCAGGATTGGCCACAGTGCGGCGGGCAGTGCCA-ACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGG  2071

Query 2072  GCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTG  2145
            |.||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2072  GTGCACCAGGACGGCCCCAGTTGTTGGCCCCACTTTCCTTCCAGAATCCTGTGTACCAGATGGCGGCCGGCCTG  2145

Query 2146  CCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGA  2219
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2146  CCACTGTCACCCCGTGGCCTTGGTGACTCAGGCTCTGAAGGCCACAGCTCCCTGAGCTCTCACAGCAACAGTGA  2219

Query 2220  GGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGC  2293
            .|||.||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||..|||||||.||.||.|
Sbjct 2220  AGAGCTGGCAGCCGCTGCCAAACTAGGAAGTTTCAGCACTGCTGCAGAGGAGCTGGCAAGGCGGCCTGGAGAAC  2293

Query 2294  TGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCC  2367
            ||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 2294  TGGCACGGAGGCAGATGTCACTGACTGAGAAGGGTGGGCAGCCCACAGTGCCGAGGCAAAATAGTGCCGGTCCC  2367

Query 2368  CAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAA  2441
            |||.|||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.||.|.
Sbjct 2368  CAGCGGAGGATTGACCAGCCGCCACCGCCACCACCACCACCGCCTCCTGCTCCCCGGGGCAGGACACCTCCTAC  2441

Query 2442  CCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCC  2515
            |||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||..||||
Sbjct 2442  CCTGCTGAGCACCCTACAGTACCCACGACCCTCAAGTGGAACCCTGGCATCAGCATCCCCCGACTGGGCTGGCC  2515

Query 2516  CCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCAC  2589
            |..|.|||||.|||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||..|||||
Sbjct 2516  CTGGCACCCGGCTGCGGCAACAGTCCTCCTCCTCCAAGGGAGACAGCCCAGAGCTGAAGCCCCGAGCCATGCAC  2589

Query 2590  AAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCA  2663
            ||||                                                                      
Sbjct 2590  AAGC----------------------------------------------------------------------  2593

Query 2664  GTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCC  2737
                                                                                      
Sbjct 2594  --------------------------------------------------------------------------  2593

Query 2738  AAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACC  2811
                     ||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2594  ---------AGGATCTGGCAGTGCTACAAGACAAGCTACGGATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACC  2658

Query 2812  CTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGA  2885
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 2659  CTATTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTATCAGGCTCGGCTGGAAGAAGGTGAGGA  2732

Query 2886  GCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGG  2959
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2733  GCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAAGACAAGGATATCCAGATGAAAGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCAGTGGAAG  2806

Query 2960  AAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAG  3033
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2807  AAGAACTGAAGAAGGATCATGCAGAGATGCAAGCAGCTGTAGATTCCAAACAGAAGATCATCGATGCCCAGGAA  2880

Query 3034  AAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TG  3105
            |||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| ||| .|
Sbjct 2881  AAGCGCATTGCCTCGCTGGATGCTGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTCACACAGCTGAAAGAGAGGTACAG  2954

Query 3106  CAT-----------------------------------------------------------------------  3108
            |||                                                                       
Sbjct 2955  CATGCAAGCCCGTAACGGCGTCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAA  3028

Query 3109  --------------  3108
                          
Sbjct 3029  ACAGCAGCAATTGT  3042