Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13291
• Subject: XM_011518267.2
• Aligned Length: 3459
• Identities: 3042
• Gaps: 417

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGAGCTGGCGGTGCCTCCTTCCGCGCCCTCGCCTGGGCCTCCCTGCCCCTGCTGGGGCCTCCAGCCTGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCTCTGCGAGGACACGCTCTGCTGCGGAGAGTCGCCTCAAGAAAGGCCGGGCTCTCGGCGCAGCCTGCCTGGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCCTTTCCGAGAAGAGCCCCAGCATGGAGCCCTCGGCCGCCACGCCGTTCCGGGTCACGGGCTTCCTCAGCCGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGCCTCAAGGGCTCCATCAAGCGCACCAAGAGCCAGCCCAAGCTGGACCGCAACCACAGCTTCCGCCACATCCT  296

Query    1  -------------------------------------------------------ATGCCGAGGCTGAAGGAGT  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCGGGGTTCCGGAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGACAATGAGAGGTCCCATCTGATGCCGAGGCTGAAGGAGT  370

Query   20  CTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTG  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTG  444

Query   94  GTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAA  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAA  518

Query  168  GTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACA  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACA  592

Query  242  AGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAG  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAG  666

Query  316  AAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGT  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGT  740

Query  390  TTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGA  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGA  814

Query  464  CCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGG  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGG  888

Query  538  CGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGAT  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGAT  962

Query  612  CCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCA  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCA  1036

Query  686  CCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCT  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCT  1110

Query  760  GCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGA  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGA  1184

Query  834  CCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCA  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCA  1258

Query  908  AGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAAC  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAAC  1332

Query  982  TGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGA  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGA  1406

Query 1056  GCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGA  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGA  1480

Query 1130  GGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTC  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTC  1554

Query 1204  CTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCAC  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCAC  1628

Query 1278  CCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGT  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGT  1702

Query 1352  CCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAG  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAG  1776

Query 1426  ACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCT  1499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCT  1850

Query 1500  CTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACG  1573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACG  1924

Query 1574  TCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCT  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCT  1998

Query 1648  GGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCAC  1721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1999  GGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCG----------------  2056

Query 1722  CCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCAC  1795
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057  --------------------------------------------------GGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCAC  2080

Query 1796  CTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCC  1869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081  CTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCC  2154

Query 1870  ATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCAC  1943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155  ATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCAC  2228

Query 1944  AGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGC  2017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229  AGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGC  2302

Query 2018  TGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAG  2091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2303  TGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAG  2376

Query 2092  CTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCT  2165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377  CTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCT  2450

Query 2166  TGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCA  2239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451  TGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCA  2524

Query 2240  AGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCA  2313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2525  AGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCA  2598

Query 2314  CTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCC  2387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2599  CTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCC  2672

Query 2388  TCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGT  2461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2673  TCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGT  2746

Query 2462  ACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAG  2535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2747  ACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAG  2820

Query 2536  CAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGT  2609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821  CAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGT  2894

Query 2610  GAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCC  2683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2895  GAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCC  2968

Query 2684  TGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCG  2757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2969  TGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCG  3042

Query 2758  GTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGA  2831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043  GTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGA  3116

Query 2832  GACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGG  2905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3117  GACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGG  3190

Query 2906  AGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCAC  2979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3191  AGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCAC  3264

Query 2980  GCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGA  3053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3265  GCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGA  3338

Query 3054  TGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGTATGCAT  3108
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3339  TGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGTATGCAT  3393