Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13291
- Subject:
- XM_024447417.1
- Aligned Length:
- 3384
- Identities:
- 3107
- Gaps:
- 276
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCCTCTGTGGCCTTGGACTTCTTAGTGACAACTTCGGCAAGATCCTGGGCCGGGCCGGAGGGGCTGCTCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGGAGACCTGGCCATCTTCGGAAGCCAGATCTGGCTCCAGAGCCTCGGGGGTTGCAAGTGCCCAGAACCAGGT 148
Query 1 -----------------------------------------ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAG 33
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGCAGAGAGGCCTGCGCTCCCACCACAAAGGTCCCATCTGATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAG 222
Query 34 TCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGT 107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGT 296
Query 108 GCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCC 181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCC 370
Query 182 GGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGG 255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGG 444
Query 256 CGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGA 329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGA 518
Query 330 GCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGC 403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGC 592
Query 404 ACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAG 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAG 666
Query 478 AAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGA 551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGA 740
Query 552 GAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGC 625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGC 814
Query 626 GCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTG 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTG 888
Query 700 GGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACAT 773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACAT 962
Query 774 CCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACA 847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACA 1036
Query 848 ACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAG 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAG 1110
Query 922 AAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCC 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCC 1184
Query 996 CAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCA 1069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCA 1258
Query 1070 AGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGC 1143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGC 1332
Query 1144 AGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCAT 1217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCAT 1406
Query 1218 CATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCG 1291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCG 1480
Query 1292 CCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAG 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAG 1554
Query 1366 TTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATAC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATAC 1628
Query 1440 AGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCA 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCA 1702
Query 1514 GCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTG 1587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTG 1776
Query 1588 AGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCAT 1661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCAT 1850
Query 1662 CTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTC 1735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTC 1924
Query 1736 CAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCG 1809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCG 1998
Query 1810 AGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCA 1883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCA 2072
Query 1884 GGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCG 1957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCG 2146
Query 1958 CTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGG 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGG 2220
Query 2032 CGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCT 2105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCT 2294
Query 2106 CTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCT 2179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCT 2368
Query 2180 CTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTC 2253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTC 2442
Query 2254 AGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGG 2327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGG 2516
Query 2328 CGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCC 2401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCC 2590
Query 2402 CGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCA 2475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCA 2664
Query 2476 AGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTC 2549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTC 2738
Query 2550 CAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCC 2623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCC 2812
Query 2624 TGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCC 2697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCC 2886
Query 2698 CCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAA 2771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAA 2960
Query 2772 GCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGC 2845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGC 3034
Query 2846 TGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATC 2919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATC 3108
Query 2920 CAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGC 2993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGC 3182
Query 2994 GGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCC 3067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCC 3256
Query 3068 GCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TGCAT------------------------------- 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| .||||
Sbjct 3257 GCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGGTACAGCATGCAAGCCCGTAACGGCATCTCCCCCACCAAC 3330
Query 3109 ------------------------------------------------------ 3108
Sbjct 3331 CCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAAACAGCAGCAATTGT 3384