Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13309
• Subject: NM_001282607.2
• Aligned Length: 1605
• Identities: 1233
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGTGGATACTGGACTGCCTTTTCGCCTCGGCCTTTGAGCCCCGCCCCCGCCGTGTGAGTGTCTTGGGAGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGCCCCAGGACACAACCCCGACCGCAGGACGAAGATGGTATCGATACACAGCCTCTCTGAGCTGGAGCGTCTGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCTGCAAGAGACTGCTTACCACGAACTCGTGGCCAGACATTTCCTCTCCGAATTCAAACCTGACAGAGCTCTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCTATTGACCGTCCGAACACCTTGGATAAGTGGTTTCTGATTTTGAGAGGACAGCAGAGGGCTGTATCACACAA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GACATTTGGCATTAGCCTGGAAGAGGTCCTGGTGAACGAGTTTACCCGCCGCAAGCATCTTGAACTGACAGCCA  370

Query    1  --ATGCAGGTTGAAGAAGCCACCGGTCAGGCTGCGGGCCGTCGTCGGGGAAACGTGGTGCGAAGGGTGTTTGGC  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGATGCAGGTTGAAGAAGCCACCGGTCAGGCTGCGGGCCGTCGTCGGGGAAACGTGGTGCGAAGGGTGTTTGGC  444

Query   73  CGCATCCGGCGCTTTTTCAGTCGCAGGCGGAATGAGCCCACCTTGCCCCGGGAGTTCACTCGCCGTGGGCGTCG  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCATCCGGCGCTTTTTCAGTCGCAGGCGGAATGAGCCCACCTTGCCCCGGGAGTTCACTCGCCGTGGGCGTCG  518

Query  147  AGGTGCAGTGTCTGTGGATAGTCTGGCTGAGCTGGAAGACGGAGCCCTGCTGCTGCAGACCCTGCAGCTTTCAA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGTGCAGTGTCTGTGGATAGTCTGGCTGAGCTGGAAGACGGAGCCCTGCTGCTGCAGACCCTGCAGCTTTCAA  592

Query  221  AAATTTCCTTTCCAATTGGCCAACGACTTCTGGGATCCAAAAGGAAGATGAGTCTCAATCCGATTGCGAAACAA  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATTTCCTTTCCAATTGGCCAACGACTTCTGGGATCCAAAAGGAAGATGAGTCTCAATCCGATTGCGAAACAA  666

Query  295  ATCCCCCAGGTTGTTGAGGCTTGCTGCCAATTCATTGAAAAACATGGCTTAAGCGCAGTGGGGATTTTTACCCT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCCCCAGGTTGTTGAGGCTTGCTGCCAATTCATTGAAAAACATGGCTTAAGCGCAGTGGGGATTTTTACCCT  740

Query  369  TGAATACTCCGTGCAGCGAGTGCGTCAGCTCCGTGAAGAATTTGATCAAGGTCTGGATGTAGTGCTGGATGACA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAATACTCCGTGCAGCGAGTGCGTCAGCTCCGTGAAGAATTTGATCAAGGTCTGGATGTAGTGCTGGATGACA  814

Query  443  ATCAGAATGTGCATGATGTGGCTGCACTCCTCAAGGAGTTTTTCCGTGACATGAAGGATTCTCTGCTGCCAGAT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCAGAATGTGCATGATGTGGCTGCACTCCTCAAGGAGTTTTTCCGTGACATGAAGGATTCTCTGCTGCCAGAT  888

Query  517  GATCTGTACATGTCATTCCTCCTGACAGCAACTTTAAAGCCCCAGGATCAGCTTTCTGCCCTGCAGTTGCTGGT  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCTGTACATGTCATTCCTCCTGACAGCAACTTTAAAGCCCCAGGATCAGCTTTCTGCCCTGCAGTTGCTGGT  962

Query  591  CTACCTGATGCCACCCTGCCACAGTGATACCCTGGAGCGTCTGCTGAAGGCCCTGCATAAAATCACTGAGAACT  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACCTGATGCCACCCTGCCACAGTGATACCCTGGAGCGTCTGCTGAAGGCCCTGCATAAAATCACTGAGAACT  1036

Query  665  GCGAGGACTCAATTGGCATTGATGGACAGTTGGTCCCAGGCAACCGTATGACTTCCACTAACTTGGCCTTGGTG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGAGGACTCAATTGGCATTGATGGACAGTTGGTCCCAGGCAACCGTATGACTTCCACTAACTTGGCCTTGGTG  1110

Query  739  TTTGGATCTGCTCTCCTGAAAAAAGGAAAGTTTGGCAAGAGAGAGTCCAGGAAAACAAAGCTGGGGATTGATCA  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTGGATCTGCTCTCCTGAAAAAAGGAAAGTTTGGCAAGAGAGAGTCCAGGAAAACAAAGCTGGGGATTGATCA  1184

Query  813  CTATGTTGCTTCTGTCAATGTGGTCCGTGCCATGATTGATAACTGGGATGTCCTCTTCCAGGTGCCTCCCCATA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTATGTTGCTTCTGTCAATGTGGTCCGTGCCATGATTGATAACTGGGATGTCCTCTTCCAGGTGCCTCCCCATA  1258

Query  887  TTCAGAGGCAGGTTGCTAAGCGCGTGTGGAAGTCCAGCCCGGAAGCACTTGATTTTATCAGACGCAGGAACTTG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGAGGCAGGTTGCTAAGCGCGTGTGGAAGTCCAGCCCGGAAGCACTTGATTTTATCAGACGCAGGAACTTG  1332

Query  961  AGGAAGATCCAGAGTGCACGCATAAAGATGGAAGAGGATGCACTACTTTCTGATCCAGTGGAAACCTCTGCTGA  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGAAGATCCAGAGTGCACGCATAAAGATGGAAGAGGATGCACTACTTTCTGATCCAGTGGAAACCTCTGCTGA  1406

Query 1035  AGCCCGGGCTGCTGTCCTTGCTCAAAGCAAGCCTTCTGATGAAGGTTCCTCTGAGGAGCCAGCTGTGCCTTCCG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCCCGGGCTGCTGTCCTTGCTCAAAGCAAGCCTTCTGATGAAGGTTCCTCTGAGGAGCCAGCTGTGCCTTCCG  1480

Query 1109  GCACTGCCCGTTCCCATGACGATGAGGAAGGAGCGGGTAACCCTCCCATTCCGGAGCAAGACCGCCCATTGCTC  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCACTGCCCGTTCCCATGACGATGAGGAAGGAGCGGGTAACCCTCCCATTCCGGAGCAAGACCGCCCATTGCTC  1554

Query 1183  CGTGTGCCCCGGGAGAAGGAGGCCAAAACTGGCGTCAGCTACTTCTTTCCT  1233
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGTGTGCCCCGGGAGAAGGAGGCCAAAACTGGCGTCAGCTACTTCTTTCCT  1605