Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13309
• Subject: NM_144967.4
• Aligned Length: 1641
• Identities: 1233
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGTGGCTGCATTCCTTTTCTGAAGGCAGCAAGGGCACTGTGCCCCAGAATCATGCCCCCTTTGCTGTTGTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTCCGCCTTCATTTTTTTAGTGAGTGTCTTGGGAGGAGCCCCAGGACACAACCCCGACCGCAGGACGAAGATGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TATCGATACACAGCCTCTCTGAGCTGGAGCGTCTGAAGCTGCAAGAGACTGCTTACCACGAACTCGTGGCCAGA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CATTTCCTCTCCGAATTCAAACCTGACAGAGCTCTGCCTATTGACCGTCCGAACACCTTGGATAAGTGGTTTCT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GATTTTGAGAGGACAGCAGAGGGCTGTATCACACAAGACATTTGGCATTAGCCTGGAAGAGGTCCTGGTGAACG  370

Query    1  --------------------------------------ATGCAGGTTGAAGAAGCCACCGGTCAGGCTGCGGGC  36
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTTTACCCGCCGCAAGCATCTTGAACTGACAGCCACGATGCAGGTTGAAGAAGCCACCGGTCAGGCTGCGGGC  444

Query   37  CGTCGTCGGGGAAACGTGGTGCGAAGGGTGTTTGGCCGCATCCGGCGCTTTTTCAGTCGCAGGCGGAATGAGCC  110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGTCGTCGGGGAAACGTGGTGCGAAGGGTGTTTGGCCGCATCCGGCGCTTTTTCAGTCGCAGGCGGAATGAGCC  518

Query  111  CACCTTGCCCCGGGAGTTCACTCGCCGTGGGCGTCGAGGTGCAGTGTCTGTGGATAGTCTGGCTGAGCTGGAAG  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCTTGCCCCGGGAGTTCACTCGCCGTGGGCGTCGAGGTGCAGTGTCTGTGGATAGTCTGGCTGAGCTGGAAG  592

Query  185  ACGGAGCCCTGCTGCTGCAGACCCTGCAGCTTTCAAAAATTTCCTTTCCAATTGGCCAACGACTTCTGGGATCC  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGGAGCCCTGCTGCTGCAGACCCTGCAGCTTTCAAAAATTTCCTTTCCAATTGGCCAACGACTTCTGGGATCC  666

Query  259  AAAAGGAAGATGAGTCTCAATCCGATTGCGAAACAAATCCCCCAGGTTGTTGAGGCTTGCTGCCAATTCATTGA  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAAGGAAGATGAGTCTCAATCCGATTGCGAAACAAATCCCCCAGGTTGTTGAGGCTTGCTGCCAATTCATTGA  740

Query  333  AAAACATGGCTTAAGCGCAGTGGGGATTTTTACCCTTGAATACTCCGTGCAGCGAGTGCGTCAGCTCCGTGAAG  406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAACATGGCTTAAGCGCAGTGGGGATTTTTACCCTTGAATACTCCGTGCAGCGAGTGCGTCAGCTCCGTGAAG  814

Query  407  AATTTGATCAAGGTCTGGATGTAGTGCTGGATGACAATCAGAATGTGCATGATGTGGCTGCACTCCTCAAGGAG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATTTGATCAAGGTCTGGATGTAGTGCTGGATGACAATCAGAATGTGCATGATGTGGCTGCACTCCTCAAGGAG  888

Query  481  TTTTTCCGTGACATGAAGGATTCTCTGCTGCCAGATGATCTGTACATGTCATTCCTCCTGACAGCAACTTTAAA  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTTTCCGTGACATGAAGGATTCTCTGCTGCCAGATGATCTGTACATGTCATTCCTCCTGACAGCAACTTTAAA  962

Query  555  GCCCCAGGATCAGCTTTCTGCCCTGCAGTTGCTGGTCTACCTGATGCCACCCTGCCACAGTGATACCCTGGAGC  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCCCAGGATCAGCTTTCTGCCCTGCAGTTGCTGGTCTACCTGATGCCACCCTGCCACAGTGATACCCTGGAGC  1036

Query  629  GTCTGCTGAAGGCCCTGCATAAAATCACTGAGAACTGCGAGGACTCAATTGGCATTGATGGACAGTTGGTCCCA  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCTGCTGAAGGCCCTGCATAAAATCACTGAGAACTGCGAGGACTCAATTGGCATTGATGGACAGTTGGTCCCA  1110

Query  703  GGCAACCGTATGACTTCCACTAACTTGGCCTTGGTGTTTGGATCTGCTCTCCTGAAAAAAGGAAAGTTTGGCAA  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCAACCGTATGACTTCCACTAACTTGGCCTTGGTGTTTGGATCTGCTCTCCTGAAAAAAGGAAAGTTTGGCAA  1184

Query  777  GAGAGAGTCCAGGAAAACAAAGCTGGGGATTGATCACTATGTTGCTTCTGTCAATGTGGTCCGTGCCATGATTG  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGAGAGTCCAGGAAAACAAAGCTGGGGATTGATCACTATGTTGCTTCTGTCAATGTGGTCCGTGCCATGATTG  1258

Query  851  ATAACTGGGATGTCCTCTTCCAGGTGCCTCCCCATATTCAGAGGCAGGTTGCTAAGCGCGTGTGGAAGTCCAGC  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATAACTGGGATGTCCTCTTCCAGGTGCCTCCCCATATTCAGAGGCAGGTTGCTAAGCGCGTGTGGAAGTCCAGC  1332

Query  925  CCGGAAGCACTTGATTTTATCAGACGCAGGAACTTGAGGAAGATCCAGAGTGCACGCATAAAGATGGAAGAGGA  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCGGAAGCACTTGATTTTATCAGACGCAGGAACTTGAGGAAGATCCAGAGTGCACGCATAAAGATGGAAGAGGA  1406

Query  999  TGCACTACTTTCTGATCCAGTGGAAACCTCTGCTGAAGCCCGGGCTGCTGTCCTTGCTCAAAGCAAGCCTTCTG  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCACTACTTTCTGATCCAGTGGAAACCTCTGCTGAAGCCCGGGCTGCTGTCCTTGCTCAAAGCAAGCCTTCTG  1480

Query 1073  ATGAAGGTTCCTCTGAGGAGCCAGCTGTGCCTTCCGGCACTGCCCGTTCCCATGACGATGAGGAAGGAGCGGGT  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGAAGGTTCCTCTGAGGAGCCAGCTGTGCCTTCCGGCACTGCCCGTTCCCATGACGATGAGGAAGGAGCGGGT  1554

Query 1147  AACCCTCCCATTCCGGAGCAAGACCGCCCATTGCTCCGTGTGCCCCGGGAGAAGGAGGCCAAAACTGGCGTCAG  1220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACCCTCCCATTCCGGAGCAAGACCGCCCATTGCTCCGTGTGCCCCGGGAGAAGGAGGCCAAAACTGGCGTCAG  1628

Query 1221  CTACTTCTTTCCT  1233
            |||||||||||||
Sbjct 1629  CTACTTCTTTCCT  1641