Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13317
- Subject:
- NM_001145727.3
- Aligned Length:
- 975
- Identities:
- 872
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAACAGCCAGTGAGAGCAGGAGACATCGGTGTTTCCAGAGTCCAGACCCACCACAATGCCAGCCCCTTCTC 74
Query 1 ----------------------------ATGATTGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATT 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGATTGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATT 148
Query 47 CAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTT 222
Query 121 GGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCT 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCT 296
Query 195 CATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCA 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCA 370
Query 269 TTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCT 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCT 444
Query 343 GAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTAT 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTAT 518
Query 417 AACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAA 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAA 592
Query 491 AATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGG 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGG 666
Query 565 ACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGA 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGA 740
Query 639 ACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCC 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCC 814
Query 713 AGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGA 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGA 888
Query 787 TTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGA 860
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGA 962
Query 861 GTCACAAAAGCAA 873
|||||||||||||
Sbjct 963 GTCACAAAAGCAA 975