Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13317
• Subject: XM_011520577.2
• Aligned Length: 1227
• Identities: 872
• Gaps: 354

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAAGATACACAAGACATTCAGGAAGCTTCGAAGGCAATGCAGAATAAAGTCCATGAGCAGGAAGATAAGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAGAAACAAAAACAAAGAGAAGACAAACTTGGAGTATATTCTTTAGTACATTTTTCCCCAAAGATGTTGGGTT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAGTTGCCACAACACTGCCATTGTCATCTTCAAATTCCAGTGGAATGCCTCTTGGTTACTATCTGTCTAGTCCT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CAGATTAGTAGAGTAACTATATCAACAACTGGACAATTGACTTCTAAAGCTACTGTAGGTAGCTGTTCCAGAGT  296

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGATTGGGGATGGAG  16
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAAAACAGCTTGGATGCCAGCCCCTTCTCAGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGATTGGGGATGGAG  370

Query   17  AAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTA  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTA  444

Query   91  AAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGA  164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGA  518

Query  165  AGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATA  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATA  592

Query  239  TTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAAT  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAAT  666

Query  313  TCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACA  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACA  740

Query  387  AGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACA  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACA  814

Query  461  CCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCT  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCT  888

Query  535  CCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACC  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACC  962

Query  609  TAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAA  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAA  1036

Query  683  CCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAA  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAA  1110

Query  757  CCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGC  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGC  1184

Query  831  CTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA  873
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA  1227