Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13317
- Subject:
- XM_011520583.1
- Aligned Length:
- 1089
- Identities:
- 872
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTTGGGTTCAGTTGCCACAACACTGCCATTGTCATCTTCAAATTCCAGTGGAATGCCTCTTGGTTACTATCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCTAGTCCTCAGATTAGTAGAGTAACTATATCAACAACTGGACAATTGACTTCTAAAGCTACTGTAGGTAGCT 148
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGATT 6
||||||
Sbjct 149 GTTCCAGAGTGGAAAACAGCTTGGATGCCAGCCCCTTCTCAGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGATT 222
Query 7 GGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCA 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCA 296
Query 81 GAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTG 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTG 370
Query 155 AAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATT 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATT 444
Query 229 GGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAAT 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAAT 518
Query 303 GCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTT 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTT 592
Query 377 GGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATT 666
Query 451 GCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTC 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTC 740
Query 525 AGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAAC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAAC 814
Query 599 AAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAA 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAA 888
Query 673 ATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCC 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCC 962
Query 747 TCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGAC 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 963 TCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGAC 1036
Query 821 CTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA 873
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA 1089