Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13331
- Subject:
- NM_001331097.1
- Aligned Length:
- 1251
- Identities:
- 1148
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCCCAGGACTCGGTGACCTTCGCAGACGTGGCTGTGAACTTCACCAAAGAGGAGTGGACCCTGCTGGACCC 74
Query 1 ----------------------------ATGCTGGAAAATTCTAGGAACTTGGCATTCATAGATTGGGCAACTC 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCTCAGAGGAATCTCTACAGAGACGTGATGCTGGAAAATTCTAGGAACTTGGCATTCATAGATTGGGCAACTC 148
Query 47 CATGTAAAACCAAAGACGCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCCTAAAAGAACATTTCCTGAAGCCAACAGGGTG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CATGTAAAACCAAAGACGCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCCTAAAAGAACATTTCCTGAAGCCAACAGAGTG 222
Query 121 TGTCTCACGAGCATCAGTTCCCAGCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACAGAGGAACCACA 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGTCTCACGAGCATCAGTTCCCAGCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACAGAGGAACCACA 296
Query 195 CAGGCAGGGGGTGAATAATGTGAAGCCACCTGCAGTTGCCCCTGAGAAAGATGAATCTCCTGTTAGCATTTGTG 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGGCAGGGGGTGAATAATGTGAAGCCACCTGCAGTTGCCCCTGAGAAAGATGAATCTCCTGTTAGCATTTGTG 370
Query 269 AAGATCATGAAATGAGGAACCACTCTAAACCTACCTGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGACAA 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGATCATGAAATGAGGAACCACTCTAAACCTACCTGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGACAA 444
Query 343 TGTATCCTAACACGTGACTCAAGTATTTTCAAGTATAATCCTGTCTTAAACGATAGTCAAAAAACACATGAAAA 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGTATCCTAACACGTGACTCAAGTATTTTCAAGTATAATCCTGTCTTAAACGATAGTCAAAAAACACATGAAAA 518
Query 417 CAACGAAGACGATGGAGTCTTGGGGTGGAACATTCAGTGGGTTCCGTGTGGGAGAAAAACAGAGCTGAAATCAA 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACGAAGACGATGGAGTCTTGGGGTGGAACATTCAGTGGGTTCCGTGTGGGAGAAAAACAGAGCTGAAATCAA 592
Query 491 GCACATGGACTGGCAGTCAGAACACTGTGCATCATATACGTGATGAAATTGATACGGGGGCCAACAGGCACCAG 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCACATGGACTGGCAGTCAGAACACTGTGCATCATATACGTGATGAAATTGATACGGGGGCCAACAGGCACCAG 666
Query 565 CGGAATCCATTTGGAAAAGCTTTCCGTGAAGACGGATCCCTTAGGGCACACAACACTCATGGTCGAGAGAAAAT 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGGAATCCATTTGGAAAAGCTTTCCGTGAAGACGGATCCCTTAGGGCACACAACACTCATGGTCGAGAGAAAAT 740
Query 639 GTATGATTTTACTCAGTGCGAGAACACCTCCAGAAATAACTCAATTCACGCCATGCAGATGCAGTTGTATACCG 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTATGATTTTACTCAGTGCGAGAACACCTCCAGAAATAACTCAATTCACGCCATGCAGATGCAGTTGTATACCG 814
Query 713 CAGAGACAAACAAGAAGGATTGTCAAACTGGGGCAACCTCTGCCAACGCTCCAAATTCCGGTTCACACAAGAGT 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGAGACAAACAAGAAGGATTGTCAAACTGGGGCAACCTCTGCCAACGCTCCAAATTCCGGTTCACACAAGAGT 888
Query 787 CATTGCACTGGAGAGAAAACCCATAAATGCCCCGAATGTGGGAGAGCCTTTTTTTATCAGTCATTCCTTATGAG 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATTGCACTGGAGAGAAAACCCATAAATGCCCCGAATGTGGGAGAGCCTTTTTTTATCAGTCATTCCTTATGAG 962
Query 861 ACATATGAAAATTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTGGGAAATGTGGGAAAGCCTTTAGATATTCCTTAC 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACATATGAAAATTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTGGGAAATGTGGGAAAGCCTTTAGATATTCCTTAC 1036
Query 935 ACCTTAATAAACATTTAAGAAAGCATGTTGTGCAGAAGAAGCCCTACGAATGTGAAGAATGTGGGAAAGTCATT 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCTTAATAAACATTTAAGAAAGCATGTTGTGCAGAAGAAGCCCTACGAATGTGAAGAATGTGGGAAAGTCATT 1110
Query 1009 CGGGAGTCCTCAAAATATACACATATAAGGAGCCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGACATGTGGAAA 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGGAGTCCTCAAAATATACACATATAAGGAGCCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGACATGTGGAAA 1184
Query 1083 AGACTTTGCAAAGTCGTCAGGACTTAAAAAACATCTTAAGACTCACAAAGATGAGAAGCCCTGTGAA 1149
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGACTTTGCAAAGTCGTCAGGACTTAAAAAACATCTTAAGACTCACAAAGATGAGAAGCCCTGTGAA 1251