Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13331
• Subject: XM_017026414.2
• Aligned Length: 1389
• Identities: 1148
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCCAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGACTGCAGTGGGAGGATCATAGCTTATTGCAACCTCCACCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCAGGCTCAGGCAATCCTCCCTCCTCAGCCTCCCGGGTAGCTGAGACTACAGGCACCCGCCCACACTCACGGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACTCGGTGACCTTCGCAGACGTGGCTGTGAACTTCACCAAAGAGGAGTGGACCCTGCTGGACCCAGCTCAGAGG  222

Query    1  ------------------ATGCTGGAAAATTCTAGGAACTTGGCATTCATAGATTGGGCAACTCCATGTAAAAC  56
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATCTCTACAGAGACGTGATGCTGGAAAATTCTAGGAACTTGGCATTCATAGATTGGGCAACTCCATGTAAAAC  296

Query   57  CAAAGACGCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCCTAAAAGAACATTTCCTGAAGCCAACAGGGTGTGTCTCACGA  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CAAAGACGCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCCTAAAAGAACATTTCCTGAAGCCAACAGAGTGTGTCTCACGA  370

Query  131  GCATCAGTTCCCAGCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACAGAGGAACCACACAGGCAGGGG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATCAGTTCCCAGCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACAGAGGAACCACACAGGCAGGGG  444

Query  205  GTGAATAATGTGAAGCCACCTGCAGTTGCCCCTGAGAAAGATGAATCTCCTGTTAGCATTTGTGAAGATCATGA  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGAATAATGTGAAGCCACCTGCAGTTGCCCCTGAGAAAGATGAATCTCCTGTTAGCATTTGTGAAGATCATGA  518

Query  279  AATGAGGAACCACTCTAAACCTACCTGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGACAATGTATCCTAA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGAGGAACCACTCTAAACCTACCTGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGACAATGTATCCTAA  592

Query  353  CACGTGACTCAAGTATTTTCAAGTATAATCCTGTCTTAAACGATAGTCAAAAAACACATGAAAACAACGAAGAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACGTGACTCAAGTATTTTCAAGTATAATCCTGTCTTAAACGATAGTCAAAAAACACATGAAAACAACGAAGAC  666

Query  427  GATGGAGTCTTGGGGTGGAACATTCAGTGGGTTCCGTGTGGGAGAAAAACAGAGCTGAAATCAAGCACATGGAC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGGAGTCTTGGGGTGGAACATTCAGTGGGTTCCGTGTGGGAGAAAAACAGAGCTGAAATCAAGCACATGGAC  740

Query  501  TGGCAGTCAGAACACTGTGCATCATATACGTGATGAAATTGATACGGGGGCCAACAGGCACCAGCGGAATCCAT  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCAGTCAGAACACTGTGCATCATATACGTGATGAAATTGATACGGGGGCCAACAGGCACCAGCGGAATCCAT  814

Query  575  TTGGAAAAGCTTTCCGTGAAGACGGATCCCTTAGGGCACACAACACTCATGGTCGAGAGAAAATGTATGATTTT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGAAAAGCTTTCCGTGAAGACGGATCCCTTAGGGCACACAACACTCATGGTCGAGAGAAAATGTATGATTTT  888

Query  649  ACTCAGTGCGAGAACACCTCCAGAAATAACTCAATTCACGCCATGCAGATGCAGTTGTATACCGCAGAGACAAA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTCAGTGCGAGAACACCTCCAGAAATAACTCAATTCACGCCATGCAGATGCAGTTGTATACCGCAGAGACAAA  962

Query  723  CAAGAAGGATTGTCAAACTGGGGCAACCTCTGCCAACGCTCCAAATTCCGGTTCACACAAGAGTCATTGCACTG  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGAAGGATTGTCAAACTGGGGCAACCTCTGCCAACGCTCCAAATTCCGGTTCACACAAGAGTCATTGCACTG  1036

Query  797  GAGAGAAAACCCATAAATGCCCCGAATGTGGGAGAGCCTTTTTTTATCAGTCATTCCTTATGAGACATATGAAA  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGAGAAAACCCATAAATGCCCCGAATGTGGGAGAGCCTTTTTTTATCAGTCATTCCTTATGAGACATATGAAA  1110

Query  871  ATTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTGGGAAATGTGGGAAAGCCTTTAGATATTCCTTACACCTTAATAA  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTGGGAAATGTGGGAAAGCCTTTAGATATTCCTTACACCTTAATAA  1184

Query  945  ACATTTAAGAAAGCATGTTGTGCAGAAGAAGCCCTACGAATGTGAAGAATGTGGGAAAGTCATTCGGGAGTCCT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACATTTAAGAAAGCATGTTGTGCAGAAGAAGCCCTACGAATGTGAAGAATGTGGGAAAGTCATTCGGGAGTCCT  1258

Query 1019  CAAAATATACACATATAAGGAGCCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGACATGTGGAAAAGACTTTGCA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAAAATATACACATATAAGGAGCCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGACATGTGGAAAAGACTTTGCA  1332

Query 1093  AAGTCGTCAGGACTTAAAAAACATCTTAAGACTCACAAAGATGAGAAGCCCTGTGAA  1149
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGTCGTCAGGACTTAAAAAACATCTTAAGACTCACAAAGATGAGAAGCCCTGTGAA  1389