Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13390
• Subject: XM_011523726.2
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1150
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  AT--GCT--GGT---TTGCT----TCAG-------------------------------ACTGTATTCTTGGCT  32
            ||  |||  |||   |||||    ||||                               .|.||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCTTCGGTATCTTGCTGTGGTCAGGAGCTGGCCTCTCTAGCTCCTTCATCTCCCCCCGGTATTCTTGGCT  74

Query   33  CTTCTTCCTGTCCCGGGGCATCGTGGGCACTGGCTCGGCCAGCTACTCCACCATCGCGCCCACCGTCCTGGGCG  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCTTCCTGTCCCGGGGCATCGTGGGCACTGGCTCGGCCAGCTACTCCACCATCGCGCCCACCGTCCTGGGCG  148

Query  107  ACCTCTTCGTGAGGGACCAGCGCACCCGCGTGCTGGCTGTCTTCTACATCTTTATCCCCGTTGGAAGTGGTCTG  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTCTTCGTGAGGGACCAGCGCACCCGCGTGCTGGCTGTCTTCTACATCTTTATCCCCGTTGGAAGTGGTCTG  222

Query  181  GGCTACGTGCTGGGGTCGGCTGTGACGATGCTGACTGGGAACTGGCGCTGGGCCCTCCGAGTCATGCCCTGCCT  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCTACGTGCTGGGGTCGGCTGTGACGATGCTGACTGGGAACTGGCGCTGGGCCCTCCGAGTCATGCCCTGCCT  296

Query  255  GGAGGCCGTGGCCTTGATCCTGCTTATCCTGCTGGTTCCAGACCCACCCCGGGGAGCTGCCGAGACACAGGGGG  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGGCCGTGGCCTTGATCCTGCTTATCCTGCTGGTTCCAGACCCACCCCGGGGAGCTGCCGAGACACAGGGGG  370

Query  329  AGGGGGCCGTGGGAGGCTTCAGAAGCAGCTGGTGTGAGGACGTCAGATACCTGGGGAAAAACTGGAGTTTTGTG  402
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGGGGGCCGTGGGAGGCTTCAGGAGCAGCTGGTGTGAGGACGTCAGATACCTGGGGAAAAACTGGAGTTTCGTG  444

Query  403  TGGTCGACCCTCGGAGTGACCGCCATGGCCTTTGTGACTGGAGCCCTGGGGTTCTGGGCCCCCAAGTTTCTGCT  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTCGACCCTCGGAGTGACCGCCATGGCCTTTGTGACTGGAGCCCTGGGGTTCTGGGCCCCCAAGTTTCTGCT  518

Query  477  CGAGGCACGCGTGGTTCACGGGCTGCAGCCTCCCTGCTTCCAGGAGCCGTGCAGCAACCCCGACAGCCTGATTT  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAGGCACGCGTGGTTCACGGGCTGCAGCCTCCCTGCTTCCAGGAGCCGTGCAGCAACCCCGACAGCCTGATTT  592

Query  551  TTGGGGCACTGACCATCATGACCGGCGTCATTGGGGTCATCTTGGGGGCAGAAGCTTCGAGGAGGTACAAGAAA  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGGGGCACTGACCATCATGACCGGCGTCATTGGGGTCATCTTGGGGGCAGAAGCTGCGAGGAGGTACAAGAAA  666

Query  625  GTCATTCCAGGAGCTGAGCCCCTCATCTGCGCCTCCAGCCTGCTTGCCACAGCCCCCTGCCTCTACCTGGCTCT  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCATTCCAGGAGCTGAGCCCCTCATCTGCGCCTCCAGCCTGCTTGCCACAGCCCCCTGCCTCTACCTGGCTCT  740

Query  699  CGTCCTGGCCCCGACCACCCTGCTGGCCTCCTATGTGTTCCTGGGCCTTGGGGAGCTGCTTCTGTCCTGCAACT  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTCCTGGCCCCGACCACCCTGCTGGCCTCCTATGTGTTCCTGGGCCTTGGGGAGCTGCTTCTGTCCTGCAACT  814

Query  773  GGGCAGTGGTTGCCGACATCCTGCTGTCTGTGGTGGTGCCCAGATGCCGGGGGACGGCAGAGGCACTTCAGATC  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCAGTGGTTGCCGACATCCTGCTGTCTGTGGTGGTGCCCAGATGCCGGGGGACGGCAGAGGCACTTCAGATC  888

Query  847  ACGGTGGGCCACATCCTGGGAGACGCTGGCAGCCCCTATCTCACAGGACTTATCTCTAGTGTCCTGCGGGCCAG  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACGGTGGGCCACATCCTGGGAGACGCTGGCAGCCCCTATCTCACAGGACTTATCTCTAGTGTCCTGCGGGCCAG  962

Query  921  GCGCCCTGACTCCTATCTGCAGCGCTTCCGCAGCCTGCAGCAGAGCTTCCTGTGCTGCGCCTTTGTCATCGCCC  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGCCCTGACTCCTATCTGCAGCGCTTCCGCAGCCTGCAGCAGAGCTTCCTGTGCTGCGCCTTTGTCATCGCCC  1036

Query  995  TGGGGGGCGGCTGCTTCCTGCTGACTGCGCTGTACCTGGAGAGAGACGAGACCCGGGCCTGGCAGCCTGTCACA  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGGGGGCGGCTGCTTCCTGCTGACTGCGCTGTACCTGGAGAGAGACGAGACCCGGGCCTGGCAGCCTGTCACA  1110

Query 1069  GGGACCCCAGACAGCAATGATGTGGACAGCAACGACCTGGAGAGACAAGGCCTACTTTCGGGCGCTGGCGCCTC  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGACCCCAGACAGCAATGATGTGGACAGCAACGACCTGGAGAGACAAGGCCTACTTTCGGGCGCTGGCGCCTC  1184

Query 1143  TACAGAGGAGCCC  1155
            |||||||||||||
Sbjct 1185  TACAGAGGAGCCC  1197