Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13399
- Subject:
- XM_006537870.3
- Aligned Length:
- 1032
- Identities:
- 840
- Gaps:
- 75
Alignment
Query 1 ATGG-TTATCA--CTCAGCCAGAT---------GAAGCT--TC-------------------TGGTCTG---CT 38
|||| ||.|.| |||...||||| |.|||| || ||| ||| |.
Sbjct 1 ATGGCTTGTGAGCCTCCCACAGATCCTGGTGGGGCAGCTGGTCCCCTGCCCACCTCTACCCTTGG-CTGCAACA 73
Query 39 TCC-------------------------------AGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATT 81
||| ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 74 TCCTGCCTCAGGGGAACCCTCCTGGCTGGGGGCAAGAGCTACACAATGGCCAGGTCCTCACAGTCCTCCGGATC 147
Query 82 GACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCGACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGGT 155
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||.|||||
Sbjct 148 GACAATACCTGTGCACCTATCTCCTTTGACCTGGGAGCTGCAGAAGAGCAACTGCAGGCCTGGGGCATTCAGGT 221
Query 156 CCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTGGCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACA 229
|||.|||||.||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 222 CCCTGCTGAGCAGTACAGGAACTTGGCTGAGAGTGCCCTTTTGGAACCTCAAGTGAGGAGGTACATCATCTACA 295
Query 230 ACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTTTGCTGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGT 303
||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 296 ACTCCAGGCCCATGAGGCTGGCCTTTGCTGTGGTGTTCTACGTGTTGGTGTGGGCCAACATCTACTCCACCAGC 369
Query 304 CAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACTGGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGAC 377
||.|||||||||.||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|.|||||||||.||..|.|||||||||.||||
Sbjct 370 CAAATGTTTGCCCTGGGCAACCAGTGGGCAGGCGTGCTGCTTGCGACCCTGGCTGCTTTCAGCCTGACCCTGAC 443
Query 378 TCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACACCAGAAGAAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATG 451
.|||||||||||||||||.||.||.||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||..||.|||||||
Sbjct 444 CCTTGTGCTGGTCTTTGAGAGGCAGCAGAGGAAGGCCAACACTAACACAGACCTGAGGCTGGTGGCCGCCAATG 517
Query 452 GAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCTGCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAAGGATGCCAGAGTGTGATTCAGCTT 525
|||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 518 GAGCCCTTCTGCGACACCGTGTGCTGCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAGGGATGCCAGAGTGTGATCCAGCTC 591
Query 526 TGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGAACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCA 599
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 592 TGGTTTGTCTACTTCGATCTGGAGAACTGTGTGCAGTTTTTGTCCGACCATGTTCAAGAGATGAAGAGGAGCCA 665
Query 600 AGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGCCAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGG 673
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||| ..|.||
Sbjct 666 AGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGCCAGCTGTGCGTTGTCATGGAGACTGGAGTGAGCCCTG---TGGTGG 736
Query 674 AGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGCTCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAG 747
|.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||.|||.|.||.|||||.|.|||||||||||||..|||
Sbjct 737 AAGGGCCCGAGGATTTGGAGGATGCTCCCCTCCTGCCCAGCACTCCTGGTCCTCAGGAGAGGCCACTCACACAG 810
Query 748 ACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTGAGGCTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGG 821
|||||.||..|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 811 ACTGAACTCTATCAGCTTGTTCCAGAGGCTGAGCCGGAGGAGATGGCCCGGCAGCTACTGGCAGTGTTTGGTGG 884
Query 822 CTACTACATCCGGCTTCTAGTGACCTCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAA 895
||||||||.||||||.||.||||||||.|.||||||||||.|||||||.||.|||||||.|.|||||.|.||.|
Sbjct 885 CTACTACACCCGGCTCCTGGTGACCTCTCGGCTCCCTCAGTCAATGGGAACGCGACACATGGACTCTGCAAGGA 958
Query 896 TTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAGCCTACA--TCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG 963
|.||||||||||||||||||||||||| |||| |.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 959 TCCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAG--TACACGTTCTGGGCACAGGATGTTGCCCGTTCCTGGCTAGG 1026