Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13399
- Subject:
- XM_011518353.1
- Aligned Length:
- 1227
- Identities:
- 841
- Gaps:
- 375
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCTGTGAACCACAGGTGGACCCGGGGGCCACTGGCCCATTGCCCCCCTCCTCCCCTGGCTGGAGTGCCCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCTGGAGGGAGCCCTCCTGGCTGGGGGCAAGCCGCCATAGAGAATATGCCAAAATATCCAGTCCTCAGCAGTG 148
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGGTTAT 8
.||.|.|.
Sbjct 149 CATGGCTGAAACCTGGGATCCTAGAATCCCAGGGCTGGAATCTCTCCCACCCCCCAGACCTCCTGGCTGCTGAC 222
Query 9 CA----CTCA----GCC------------------AGAT---GAAGCTTCTGGTCTGCTTC------------- 40
|| |||| ||| |||| ||..|||.||..|.|.|||
Sbjct 223 CAGTGGCTCACAGGGCCTTGTACTGTGGTGCAAGGAGATCTCGATCCTTTTGTCCAGTTTCTCTACTTGGAACT 296
Query 41 -----CAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCG 109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAGGCAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGGATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCG 370
Query 110 ACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATC---CAGGTCCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCTGGGAGCCGCAGAAGAGCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGCAGGTCCCGGCTGACCAGTACAGGAGCTTG 444
Query 181 GCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTT 254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATATATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTT 518
Query 255 TGCTGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACT 328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCTGTGGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGTTTGCCTTGGGGAACCACT 592
Query 329 GGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACAC 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCGGTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACAC 666
Query 403 CAGAAGAAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATGGAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCT 476
|||||||
Sbjct 667 CAGAAGA------------------------------------------------------------------- 673
Query 477 GCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAAGGATGCCAGAGTGTGATTCAGCTTTGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674 --------------------------------------------AGCTTTGGTTTGTCTACTTCGACCTGGAGA 703
Query 551 ACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCAAGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTG 624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 704 ACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGACTAGCCAAGAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTG 777
Query 625 AGCCAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGC 698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 AGCCAGTTGTGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGAGAACTTGGAGGATGC 851
Query 699 TCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTG 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 852 TCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGAGGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTG 925
Query 773 AGGCTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTACTACATCCGGCTTCTAGTGACC 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 926 AGGCTGAGCCGGAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTACTACATCCGGCTTCTAGTGACC 999
Query 847 TCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGA 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 TCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACACGACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGA 1073
Query 921 AGCCTACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG 963
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 AGCCTACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG 1116